86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1927 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1927  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 509 aa  1008    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  49.22 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  40 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  30.92 
 
 		 511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  28.3 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 		 530 aa  186  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 		 493 aa  183  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  28.44 
 
 		 503 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.02 
 
 		 518 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  24.81 
 
 		 527 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  26.46 
 
 		 528 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  26.92 
 
 		 532 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  27.19 
 
 		 533 aa  170  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  28.6 
 
 		 514 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  27.75 
 
 		 510 aa  157  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  27.05 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  27.2 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  26.21 
 
 		 519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  27.61 
 
 		 480 aa  147  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  25.67 
 
 		 517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0585  lipopolysaccharide biosynthesis  24.65 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  22.6 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  25.93 
 
 		 505 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  21.22 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 474 aa  95.9  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  22.11 
 
 		 518 aa  90.1  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.09 
 
 		 499 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.49 
 
 		 499 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 		 520 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  23.61 
 
 		 490 aa  87.8  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  20.32 
 
 		 499 aa  76.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.12 
 
 		 507 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.27 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0298  hypothetical protein  22.83 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02221  hypothetical protein  22.58 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  24.43 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  23.87 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.34 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  23.06 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.63 
 
 		 750 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 		 724 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.91 
 
 		 720 aa  55.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  22.04 
 
 		 753 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  29.41 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2407  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 601 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3542 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 671 aa  54.3  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  20.6 
 
 		 737 aa  54.3  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 804 aa  53.5  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 760 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0831  chain length determinant family protein  23.24 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.73 
 
 		 743 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 726 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 		 778 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  21.24 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.19 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  22.59 
 
 		 738 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  22.74 
 
 		 736 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  21.82 
 
 		 478 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  22.81 
 
 		 747 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0688  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.07 
 
 		 480 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.36 
 
 		 734 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  23.71 
 
 		 232 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  22.45 
 
 		 461 aa  47  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 		 643 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  22.27 
 
 		 469 aa  47  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  25.68 
 
 		 232 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  22.16 
 
 		 727 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  25.14 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  24.02 
 
 		 709 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  21.55 
 
 		 755 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.27 
 
 		 711 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  21.47 
 
 		 739 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 759 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 		 642 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  23.45 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  23.21 
 
 		 734 aa  44.3  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  23.3 
 
 		 753 aa  43.9  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.89 
 
 		 409 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  28.1 
 
 		 757 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0889  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.58 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>