235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3191 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  95.6 
 
 		 477 aa  893    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 477 aa  962    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  50.96 
 
 		 487 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  30.33 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3715  lipopolysaccharide biosynthesis  25.82 
 
 		 712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 642 aa  119  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 		 643 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 730 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.23 
 
 		 756 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  27.78 
 
 		 518 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.75 
 
 		 790 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.4 
 
 		 750 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.98 
 
 		 720 aa  98.2  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 804 aa  93.6  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.44 
 
 		 806 aa  89.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.5 
 
 		 734 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.57 
 
 		 514 aa  87.4  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  22.36 
 
 		 466 aa  87  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.5 
 
 		 711 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  21.69 
 
 		 872 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  21.7 
 
 		 743 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  24.16 
 
 		 662 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 737 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.5 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  23.96 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  22.34 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  21.99 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.02 
 
 		 727 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  21.07 
 
 		 528 aa  79.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  23.53 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  21.88 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  22.54 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  22.13 
 
 		 741 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 530 aa  76.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  22.92 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  0.0655667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.2 
 
 		 779 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  22.09 
 
 		 738 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  20.05 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  20.96 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.75 
 
 		 721 aa  73.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  21.66 
 
 		 753 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 671 aa  73.6  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  23.85 
 
 		 767 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 738 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.38 
 
 		 745 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  22.61 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  19.25 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.82 
 
 		 747 aa  70.5  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  19.92 
 
 		 753 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  25.19 
 
 		 802 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  21.25 
 
 		 737 aa  69.7  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  19.11 
 
 		 527 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  19.84 
 
 		 731 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  22.85 
 
 		 727 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  21.19 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  24.29 
 
 		 524 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.12 
 
 		 739 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.77 
 
 		 788 aa  68.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  20.45 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3304  lipopolysaccharide biosynthesis  22.38 
 
 		 663 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417507  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  22.16 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3532  exopolysaccharide biosythesis protein PslE  23.2 
 
 		 663 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.393187  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  30.71 
 
 		 740 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  19.1 
 
 		 708 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  22.61 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  19.83 
 
 		 736 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  22.38 
 
 		 770 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1960  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 		 704 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38724  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.84 
 
 		 653 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  22.09 
 
 		 740 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  24.21 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1529  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.7 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417351  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  39.44 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.61 
 
 		 780 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  21.12 
 
 		 746 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  21.18 
 
 		 503 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  26.61 
 
 		 781 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0585  lipopolysaccharide biosynthesis  22.76 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.37 
 
 		 742 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  21.9 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  21.8 
 
 		 734 aa  62.4  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  23.74 
 
 		 759 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5484  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.95785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4969  hypothetical protein  22.98 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.24 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.06 
 
 		 766 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  20.94 
 
 		 755 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  21.86 
 
 		 797 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  20.22 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 		 761 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  22.07 
 
 		 802 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  35.71 
 
 		 757 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  25.6 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  20.04 
 
 		 726 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  36.62 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>