190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0688 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0688  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  100 
 
 		 480 aa  958    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403997 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  77.5 
 
 		 500 aa  743    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0831  chain length determinant family protein  47.53 
 
 		 502 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  42.76 
 
 		 489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.38 
 
 		 507 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  36.79 
 
 		 499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  37.47 
 
 		 499 aa  296  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  36.82 
 
 		 499 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  38.7 
 
 		 490 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  30.66 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.63 
 
 		 518 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  26.19 
 
 		 514 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  25.22 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  27.02 
 
 		 519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  24.02 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  24.95 
 
 		 533 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  28.06 
 
 		 480 aa  120  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  25.12 
 
 		 503 aa  120  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 520 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  24.6 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  23.7 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  25.35 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  25.45 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  23.33 
 
 		 507 aa  106  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 493 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 512 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  23.41 
 
 		 514 aa  98.6  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 520 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  22.46 
 
 		 524 aa  97.1  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  22.6 
 
 		 519 aa  95.5  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 520 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  22.78 
 
 		 505 aa  86.7  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2831  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2407  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 601 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  24.66 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 575 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.75 
 
 		 790 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2616  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.162079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  23.08 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  22.98 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.07 
 
 		 750 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  27.88 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.618609  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  23.88 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  28.57 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  23.09 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2736  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00743206  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  22.26 
 
 		 720 aa  70.5  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  22.54 
 
 		 734 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  20.73 
 
 		 719 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  23.04 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  20.43 
 
 		 719 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  20.43 
 
 		 719 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  20.43 
 
 		 719 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 474 aa  67  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  23.62 
 
 		 727 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  21.11 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  21.95 
 
 		 720 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  21.95 
 
 		 720 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0243  lipopolysaccharide biosynthesis  22.76 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  21.95 
 
 		 720 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  21.95 
 
 		 720 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  21.95 
 
 		 720 aa  63.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 804 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  21.95 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  21.95 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  19.83 
 
 		 731 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 745 aa  62.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.8 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  22.59 
 
 		 794 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  19.32 
 
 		 743 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  21.65 
 
 		 720 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  20.65 
 
 		 723 aa  60.5  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0427  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like protein  21.21 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0403226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 718 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  22.85 
 
 		 756 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  21.31 
 
 		 753 aa  60.1  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  21.73 
 
 		 719 aa  60.1  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.89 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0298  hypothetical protein  22.41 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  24.37 
 
 		 756 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.29 
 
 		 806 aa  57  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  23.55 
 
 		 726 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 548 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 		 537 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  22.02 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.01 
 
 		 779 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.95 
 
 		 722 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  21.3 
 
 		 746 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  20.13 
 
 		 753 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  24.78 
 
 		 772 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  21.59 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  21.7 
 
 		 740 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  21.49 
 
 		 711 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  20.11 
 
 		 726 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  23.43 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  23.7 
 
 		 710 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  22.05 
 
 		 727 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4239  lipopolysaccharide biosynthesis  19.01 
 
 		 517 aa  54.3  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>