44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3858 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3858  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 735 aa  1503    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 715 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0263254  hitchhiker  0.000489248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3703  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 729 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000380193  normal  0.301221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0165  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354505  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.73 
 
 		 755 aa  62.4  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  21.47 
 
 		 740 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  23.5 
 
 		 480 aa  55.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.51 
 
 		 741 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.62 
 
 		 720 aa  53.9  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  21.1 
 
 		 790 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  26.06 
 
 		 748 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  27.85 
 
 		 734 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  22.94 
 
 		 753 aa  51.6  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  22.67 
 
 		 721 aa  51.6  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  22.16 
 
 		 478 aa  51.2  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  25.56 
 
 		 741 aa  51.2  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  26.46 
 
 		 741 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.46 
 
 		 741 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  26.46 
 
 		 741 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.56 
 
 		 741 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  25.56 
 
 		 741 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.87 
 
 		 739 aa  49.7  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  26.87 
 
 		 739 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  26.87 
 
 		 739 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  25.33 
 
 		 796 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  20.29 
 
 		 514 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  26.37 
 
 		 739 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.89 
 
 		 643 aa  47.8  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.09 
 
 		 720 aa  47.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 463 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  19.91 
 
 		 722 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  21.56 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  29.81 
 
 		 760 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  20.5 
 
 		 804 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  23 
 
 		 784 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  23.16 
 
 		 741 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.52 
 
 		 736 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  26.47 
 
 		 755 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  24.78 
 
 		 784 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.66 
 
 		 642 aa  45.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.83 
 
 		 734 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  23.04 
 
 		 795 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.81 
 
 		 760 aa  43.9  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  23.53 
 
 		 757 aa  43.9  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>