232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3703 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3703  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 729 aa  1483    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000380193  normal  0.301221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0165  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 		 726 aa  200  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354505  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 715 aa  188  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0263254  hitchhiker  0.000489248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  20.95 
 
 		 755 aa  98.6  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  21.04 
 
 		 710 aa  81.3  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  25.77 
 
 		 464 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3858  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 		 735 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.43 
 
 		 722 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  20.76 
 
 		 804 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  20.23 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.47 
 
 		 721 aa  74.3  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  22.9 
 
 		 803 aa  73.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  21.32 
 
 		 727 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.61 
 
 		 482 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.64 
 
 		 235 aa  73.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  20.82 
 
 		 750 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.13 
 
 		 734 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  24.02 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.29 
 
 		 742 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 738 aa  70.9  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4219  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 685 aa  70.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  20.59 
 
 		 756 aa  70.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  23.73 
 
 		 527 aa  70.1  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.68 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  22.26 
 
 		 741 aa  68.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  22.81 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  22 
 
 		 708 aa  68.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.4 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  19.44 
 
 		 745 aa  68.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  21.59 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.49 
 
 		 739 aa  67.8  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  23.13 
 
 		 756 aa  67.8  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  21.35 
 
 		 766 aa  67.4  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  21.09 
 
 		 727 aa  67.4  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  21.68 
 
 		 727 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  25.5 
 
 		 667 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  27.64 
 
 		 205 aa  66.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  20.61 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  20.03 
 
 		 743 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  28.57 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  26.34 
 
 		 585 aa  63.5  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.7 
 
 		 741 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 751 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.16 
 
 		 741 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  23.4 
 
 		 772 aa  63.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  20.51 
 
 		 794 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 751 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  24.88 
 
 		 615 aa  62  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  21.7 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  22.37 
 
 		 770 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.7 
 
 		 741 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  20.94 
 
 		 763 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  19.62 
 
 		 795 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  20.63 
 
 		 790 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  24.44 
 
 		 746 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  24.23 
 
 		 529 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  20.29 
 
 		 789 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  21.88 
 
 		 711 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  22.12 
 
 		 815 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  20.33 
 
 		 737 aa  58.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.33 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  20.95 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  21.33 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  21.33 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  20.73 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0449  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  19.87 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  20.11 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  23.19 
 
 		 233 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  23.41 
 
 		 233 aa  57  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  23.15 
 
 		 257 aa  57  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  23.33 
 
 		 477 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.76 
 
 		 748 aa  56.2  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  23.2 
 
 		 720 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  25.36 
 
 		 246 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  21 
 
 		 492 aa  56.2  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  22.59 
 
 		 795 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  21.67 
 
 		 732 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.38 
 
 		 220 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  23.41 
 
 		 233 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  22.5 
 
 		 720 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  22.02 
 
 		 744 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  21.02 
 
 		 741 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.7 
 
 		 779 aa  55.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  22.93 
 
 		 233 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  22.5 
 
 		 720 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  19.46 
 
 		 872 aa  55.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  23.74 
 
 		 474 aa  55.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  23.48 
 
 		 720 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  22.93 
 
 		 233 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  19.79 
 
 		 726 aa  55.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12770  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 279 aa  55.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  20.95 
 
 		 739 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.41 
 
 		 234 aa  55.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  20.95 
 
 		 739 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  23.84 
 
 		 721 aa  54.7  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  21.05 
 
 		 723 aa  55.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  23.2 
 
 		 720 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>