More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0587 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3557  lipopolysaccharide biosynthesis protein  82.11 
 
 
710 aa  1191    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  61.66 
 
 
710 aa  843    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
710 aa  1456    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.73 
 
 
737 aa  279  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.39 
 
 
756 aa  265  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.82 
 
 
755 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 
731 aa  237  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  26.77 
 
 
726 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 
738 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.4 
 
 
770 aa  190  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  22.19 
 
 
753 aa  171  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  24.71 
 
 
708 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  24.23 
 
 
733 aa  154  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
730 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.87 
 
 
737 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.04 
 
 
721 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.01 
 
 
743 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.84 
 
 
745 aa  125  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  25.11 
 
 
527 aa  125  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.14 
 
 
779 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  23.8 
 
 
734 aa  120  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  22.72 
 
 
711 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.13 
 
 
722 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  23.16 
 
 
758 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  20.87 
 
 
727 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  23.3 
 
 
758 aa  111  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.34 
 
 
739 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  21.99 
 
 
734 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  22.5 
 
 
872 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.69 
 
 
772 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  21.63 
 
 
750 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  22.38 
 
 
756 aa  104  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  22.4 
 
 
797 aa  104  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  21.91 
 
 
772 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  21.25 
 
 
756 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  23.99 
 
 
472 aa  100  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  21.65 
 
 
710 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.96 
 
 
779 aa  99  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  23.47 
 
 
461 aa  97.4  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.87 
 
 
720 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  22.77 
 
 
738 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
467 aa  95.9  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 
745 aa  95.9  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 
764 aa  95.5  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  22.69 
 
 
466 aa  94.4  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.71 
 
 
742 aa  93.6  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.03 
 
 
722 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  20.79 
 
 
756 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  22.35 
 
 
788 aa  92  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.12 
 
 
806 aa  92  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 
804 aa  89.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.68 
 
 
739 aa  88.6  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  20.9 
 
 
469 aa  87.8  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 
785 aa  87.8  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  22.35 
 
 
774 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 
748 aa  85.5  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  21.32 
 
 
740 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  23.36 
 
 
775 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  22.95 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.14 
 
 
720 aa  82.8  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  23.75 
 
 
795 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  21.34 
 
 
747 aa  82  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  30.11 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.91 
 
 
724 aa  81.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  19.78 
 
 
475 aa  80.5  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  22.71 
 
 
727 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  20.95 
 
 
740 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  22.46 
 
 
776 aa  80.1  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  23.27 
 
 
720 aa  80.1  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 
749 aa  80.5  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.29 
 
 
741 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.11 
 
 
217 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  23.83 
 
 
723 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  25.54 
 
 
759 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  22.22 
 
 
820 aa  78.2  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  28.8 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  23.72 
 
 
778 aa  77.8  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  22.21 
 
 
753 aa  77.4  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  21.22 
 
 
472 aa  76.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  20.87 
 
 
736 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  22.74 
 
 
772 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 
766 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
761 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
588 aa  74.7  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  21.29 
 
 
782 aa  74.3  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 
737 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  22.19 
 
 
719 aa  73.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.64 
 
 
741 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.64 
 
 
741 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.64 
 
 
741 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  22.19 
 
 
719 aa  73.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
751 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  22.19 
 
 
719 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
724 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1176  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-N  22.83 
 
 
317 aa  72.8  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  21.36 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  23.49 
 
 
734 aa  72.4  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  22.19 
 
 
719 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  22.1 
 
 
740 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  21.92 
 
 
719 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>