267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1844 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1007  exopolysaccharide biosynthesis-related uncharacterized protein  50.07 
 
 		 750 aa  722    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.790417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1844  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 773 aa  1577    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1819  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like  62.22 
 
 		 764 aa  961    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1370  hypothetical protein  40.79 
 
 		 751 aa  585  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.250473  normal  0.334158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1429  chain length determinant protein  22.69 
 
 		 706 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 730 aa  103  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.87 
 
 		 711 aa  95.9  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25.08 
 
 		 750 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  20.27 
 
 		 755 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.6 
 
 		 721 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  20.34 
 
 		 734 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  21.33 
 
 		 756 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 737 aa  80.9  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.07 
 
 		 742 aa  80.9  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.83 
 
 		 220 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.61 
 
 		 790 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  20.67 
 
 		 743 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  22.63 
 
 		 741 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  28.25 
 
 		 726 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  25.81 
 
 		 505 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  25.62 
 
 		 747 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  24.64 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.89 
 
 		 779 aa  74.7  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  21.2 
 
 		 770 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.37 
 
 		 806 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  25.65 
 
 		 784 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.56 
 
 		 741 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.04 
 
 		 741 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  21.56 
 
 		 733 aa  72.8  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  27.41 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 731 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.04 
 
 		 741 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.04 
 
 		 741 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  29.61 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.04 
 
 		 741 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  21.56 
 
 		 750 aa  72  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.78 
 
 		 724 aa  72  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  23.83 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  26.27 
 
 		 820 aa  70.1  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  20.63 
 
 		 741 aa  70.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 804 aa  70.1  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  28.29 
 
 		 750 aa  69.7  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  25.91 
 
 		 802 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  22.92 
 
 		 724 aa  68.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.47 
 
 		 741 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  20.48 
 
 		 772 aa  69.3  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  21.76 
 
 		 753 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  23.32 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  25.1 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  25.51 
 
 		 764 aa  68.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  24.58 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  25.9 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  23.14 
 
 		 786 aa  67.4  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  23.9 
 
 		 801 aa  67.4  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  24.64 
 
 		 744 aa  67  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  21.2 
 
 		 774 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  25.5 
 
 		 738 aa  67  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  22.82 
 
 		 747 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  22.44 
 
 		 508 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.56 
 
 		 756 aa  66.6  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  20.18 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  25.88 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  22.51 
 
 		 744 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.15 
 
 		 800 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  23.62 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  23.29 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  22.25 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  22.51 
 
 		 744 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.05 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.05 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.05 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  21.05 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.05 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.05 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  24.79 
 
 		 754 aa  64.3  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.05 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  21.05 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  24.43 
 
 		 745 aa  64.3  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.32 
 
 		 575 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  26.56 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.37 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4163  lipopolysaccharide biosynthesis  24.77 
 
 		 748 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  21.59 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4203  lipopolysaccharide biosynthesis  24.77 
 
 		 748 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  22.22 
 
 		 735 aa  63.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 735 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  26 
 
 		 525 aa  62.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  26.19 
 
 		 796 aa  62.4  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.29 
 
 		 739 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.04 
 
 		 736 aa  61.6  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  25.2 
 
 		 755 aa  61.6  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  24.41 
 
 		 759 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  27.64 
 
 		 784 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  24.56 
 
 		 740 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  25.45 
 
 		 778 aa  60.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.13 
 
 		 780 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>