159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1007 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1370  hypothetical protein  47.16 
 
 		 751 aa  734    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.250473  normal  0.334158 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1007  exopolysaccharide biosynthesis-related uncharacterized protein  100 
 
 		 750 aa  1546    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.790417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1819  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like  51.87 
 
 		 764 aa  779    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1844  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis  50.07 
 
 		 773 aa  721    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1429  chain length determinant protein  22.26 
 
 		 706 aa  127  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  21.25 
 
 		 711 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.83 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  21.27 
 
 		 743 aa  71.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.91 
 
 		 790 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  21.29 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  27.09 
 
 		 820 aa  64.3  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.56 
 
 		 726 aa  63.9  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  23.15 
 
 		 727 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  25.34 
 
 		 753 aa  62  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 731 aa  62  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.35 
 
 		 721 aa  62  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 730 aa  61.6  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  23.13 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.57 
 
 		 741 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.97 
 
 		 742 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.7 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  21.32 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  26.09 
 
 		 736 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  27.27 
 
 		 736 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.08 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.76 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.76 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.76 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.19 
 
 		 779 aa  58.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.36 
 
 		 770 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.14 
 
 		 727 aa  57.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  26.55 
 
 		 527 aa  57  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  21.83 
 
 		 756 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.31 
 
 		 741 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.31 
 
 		 741 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  19.71 
 
 		 737 aa  57.4  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  29.73 
 
 		 721 aa  57.4  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.32 
 
 		 806 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  21.13 
 
 		 778 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  25.1 
 
 		 755 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  24.29 
 
 		 746 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  26.26 
 
 		 257 aa  55.1  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  24.73 
 
 		 747 aa  55.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  24.29 
 
 		 746 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  24.29 
 
 		 746 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  25.75 
 
 		 716 aa  55.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  23.17 
 
 		 733 aa  55.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  27.32 
 
 		 750 aa  54.7  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.06 
 
 		 745 aa  54.7  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  24.67 
 
 		 754 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  22.66 
 
 		 734 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  21.73 
 
 		 739 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  25.15 
 
 		 745 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  22.82 
 
 		 464 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 761 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  21.9 
 
 		 492 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  26.05 
 
 		 753 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.64 
 
 		 732 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  23.98 
 
 		 731 aa  52.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.53 
 
 		 755 aa  52.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  25.75 
 
 		 252 aa  52  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.1 
 
 		 772 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  25.65 
 
 		 747 aa  52  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  26.55 
 
 		 741 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.06 
 
 		 230 aa  52  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.06 
 
 		 230 aa  52  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.01 
 
 		 482 aa  52  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.27 
 
 		 740 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  21.75 
 
 		 508 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.14 
 
 		 726 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  23.14 
 
 		 741 aa  51.6  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  25 
 
 		 746 aa  51.2  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  24.56 
 
 		 745 aa  50.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  19.63 
 
 		 724 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  27.68 
 
 		 759 aa  50.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  25.4 
 
 		 802 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  24.86 
 
 		 249 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.42 
 
 		 289 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  24.86 
 
 		 624 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.53 
 
 		 726 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  26.53 
 
 		 726 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  26.42 
 
 		 764 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.53 
 
 		 726 aa  50.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.53 
 
 		 726 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 735 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4163  lipopolysaccharide biosynthesis  22.14 
 
 		 748 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  26.53 
 
 		 726 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4203  lipopolysaccharide biosynthesis  22.14 
 
 		 748 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  24.86 
 
 		 605 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  25.88 
 
 		 815 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.53 
 
 		 726 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.53 
 
 		 726 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  26.53 
 
 		 724 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.09 
 
 		 235 aa  49.7  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.53 
 
 		 726 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  26.05 
 
 		 756 aa  49.3  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 738 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 		 302 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  25.29 
 
 		 744 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  26.83 
 
 		 246 aa  48.1  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>