More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1819 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1844  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis  62.22 
 
 
773 aa  961    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1007  exopolysaccharide biosynthesis-related uncharacterized protein  51.87 
 
 
750 aa  775    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.790417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1819  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like  100 
 
 
764 aa  1558    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1370  hypothetical protein  39.86 
 
 
751 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.250473  normal  0.334158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1429  chain length determinant protein  24.23 
 
 
706 aa  153  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  22.76 
 
 
741 aa  93.6  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 
737 aa  93.2  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 
730 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.31 
 
 
779 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  20.92 
 
 
756 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  21.45 
 
 
711 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  27.48 
 
 
741 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  27.82 
 
 
802 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.83 
 
 
720 aa  78.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  28.94 
 
 
756 aa  77  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  27.62 
 
 
756 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 
738 aa  76.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 
749 aa  75.9  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.61 
 
 
742 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.19 
 
 
734 aa  73.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.17 
 
 
806 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.55 
 
 
790 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.5 
 
 
721 aa  71.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.14 
 
 
772 aa  71.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.7 
 
 
720 aa  70.9  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.98 
 
 
726 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  25.7 
 
 
747 aa  70.5  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  25.63 
 
 
753 aa  69.7  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  19.46 
 
 
755 aa  69.7  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  28.28 
 
 
745 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  21.69 
 
 
743 aa  68.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  21.16 
 
 
750 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.25 
 
 
726 aa  67.8  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  23.81 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
804 aa  67.4  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  25.35 
 
 
745 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  23.12 
 
 
784 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  28.42 
 
 
746 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  26.04 
 
 
764 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  29.1 
 
 
745 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  28.42 
 
 
746 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  29.8 
 
 
745 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  28.42 
 
 
746 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  23.33 
 
 
527 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  24.04 
 
 
727 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.12 
 
 
736 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  23.4 
 
 
496 aa  65.1  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  24.39 
 
 
747 aa  65.1  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  21.78 
 
 
727 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  23.85 
 
 
775 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.1 
 
 
738 aa  64.3  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  24.62 
 
 
492 aa  64.3  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  26.34 
 
 
796 aa  63.9  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  26.13 
 
 
754 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.38 
 
 
235 aa  63.9  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  20.92 
 
 
778 aa  63.9  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  27.8 
 
 
764 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  28.42 
 
 
746 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.45 
 
 
741 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  26.25 
 
 
246 aa  63.9  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.54 
 
 
741 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.4 
 
 
727 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  25.85 
 
 
721 aa  63.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  21.17 
 
 
733 aa  63.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  24.88 
 
 
744 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5483  chromosome partitioning ATPase  28.21 
 
 
213 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  23.77 
 
 
464 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  29.15 
 
 
755 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  30.82 
 
 
741 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  25.37 
 
 
744 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.59 
 
 
737 aa  62.4  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.48 
 
 
741 aa  62  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  26.96 
 
 
740 aa  62  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  23.68 
 
 
786 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.14 
 
 
220 aa  62  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.3 
 
 
770 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  25.74 
 
 
221 aa  61.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  28.65 
 
 
244 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  26.86 
 
 
225 aa  61.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  24.71 
 
 
443 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  27.78 
 
 
721 aa  60.8  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  26.16 
 
 
217 aa  60.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  27.88 
 
 
795 aa  60.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  22 
 
 
469 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  26.86 
 
 
225 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 
731 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  23.14 
 
 
466 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  23.47 
 
 
624 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  25.98 
 
 
820 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 
240 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 
745 aa  60.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  24.71 
 
 
497 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  24 
 
 
794 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  24.5 
 
 
751 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  25.38 
 
 
722 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  24.08 
 
 
508 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  23.58 
 
 
605 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.36 
 
 
575 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  22.67 
 
 
474 aa  58.9  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  25.66 
 
 
746 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>