More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5483 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5483  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
213 aa  410  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.15 
 
 
575 aa  98.2  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  37.43 
 
 
733 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  32.95 
 
 
453 aa  92  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.26 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  25.52 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  33.14 
 
 
492 aa  88.6  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.1 
 
 
228 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.1 
 
 
228 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  24.16 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0976  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.71 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503924  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  28.49 
 
 
257 aa  86.3  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2878  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  28.11 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  30.81 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  25.52 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.81 
 
 
721 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  28.11 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  23.98 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  30.99 
 
 
492 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  29.38 
 
 
820 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  23.98 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  28.83 
 
 
741 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  24.61 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  31.21 
 
 
727 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.48 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  23.56 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.08 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  23.66 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  24.61 
 
 
464 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  31.61 
 
 
778 aa  79.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  30.65 
 
 
624 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  24.61 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  25.4 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  25.4 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  27.17 
 
 
763 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  29.57 
 
 
605 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  25.4 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  24.87 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  24.44 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  24.87 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  23.83 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  28.5 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  28.24 
 
 
742 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.34 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  29.41 
 
 
734 aa  75.1  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  28.11 
 
 
708 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 
737 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  28.65 
 
 
764 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 
745 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  25.96 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  27.01 
 
 
585 aa  74.3  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  29.76 
 
 
527 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  23.47 
 
 
739 aa  73.6  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  30.17 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.25 
 
 
720 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  27.27 
 
 
801 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  29.01 
 
 
795 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  28.49 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2022  chromosome partitioning ATPase  30.16 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  32.49 
 
 
776 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 
524 aa  71.6  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  27.78 
 
 
454 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  32.24 
 
 
736 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  26.62 
 
 
803 aa  71.6  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  27.62 
 
 
753 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  25.64 
 
 
803 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  35.63 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  32 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  29.8 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  28.99 
 
 
790 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  28.49 
 
 
496 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.45 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  29.34 
 
 
790 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 
751 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  27.65 
 
 
756 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0150  hypothetical protein  29.31 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  30.81 
 
 
615 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 
751 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12770  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  27.03 
 
 
753 aa  68.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  30 
 
 
474 aa  68.6  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.23 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1420  capsular exopolysaccharide family  29.48 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0943338  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  31.43 
 
 
484 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.87 
 
 
726 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  32.65 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.55 
 
 
800 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  29.52 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.57 
 
 
739 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 
730 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  26.77 
 
 
755 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  28.82 
 
 
722 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 
713 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  29.67 
 
 
737 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  26.26 
 
 
806 aa  67  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  28.43 
 
 
469 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.51 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.51 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  29.41 
 
 
508 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>