More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0150 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0150  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1879  protein-tyrosine kinase  47.57 
 
 
299 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1793  hypothetical protein  47.64 
 
 
296 aa  225  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.677381  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0244  protein-tyrosine kinase  47.43 
 
 
309 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2024  protein-tyrosine kinase  44.53 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.607078  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1377  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.7 
 
 
300 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0736  tyrosine kinase  38.55 
 
 
315 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2365  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.8 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2732  tyrosine kinase  36.3 
 
 
303 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0677811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  35.96 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  35.96 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  35.96 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  35.96 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.96 
 
 
234 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  33.66 
 
 
232 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  35.47 
 
 
233 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  35.03 
 
 
721 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.32 
 
 
220 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.64 
 
 
741 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  38.54 
 
 
780 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.44 
 
 
225 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  37.75 
 
 
755 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  42.53 
 
 
721 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  34.93 
 
 
751 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  35.27 
 
 
731 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  33.17 
 
 
217 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.65 
 
 
575 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.67 
 
 
217 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.64 
 
 
741 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  37.2 
 
 
726 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  35.64 
 
 
741 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  33.99 
 
 
225 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  35.15 
 
 
741 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  36.62 
 
 
734 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  34.15 
 
 
724 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  34.7 
 
 
790 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.27 
 
 
240 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  36.41 
 
 
225 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  33.99 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  32.73 
 
 
721 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  35.15 
 
 
741 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.15 
 
 
741 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  35.15 
 
 
741 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.06 
 
 
730 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  35.92 
 
 
745 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  33.5 
 
 
257 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  39.88 
 
 
731 aa  118  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  33.99 
 
 
225 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  29.67 
 
 
724 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.82 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.82 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  34.74 
 
 
727 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.03 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.03 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  32.2 
 
 
723 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  33.99 
 
 
747 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  33.01 
 
 
735 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  35.15 
 
 
804 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  37.62 
 
 
722 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  37.5 
 
 
726 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  33.5 
 
 
246 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  36.09 
 
 
739 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  33 
 
 
734 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  36.84 
 
 
739 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  40.99 
 
 
774 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  37.44 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  36.08 
 
 
741 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  31.86 
 
 
759 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.61 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  33.01 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.35 
 
 
464 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  32.2 
 
 
720 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  28.95 
 
 
217 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  34.55 
 
 
753 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  32.52 
 
 
716 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  35.96 
 
 
474 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  37.57 
 
 
453 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  36.46 
 
 
739 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  36.46 
 
 
739 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  36.46 
 
 
739 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  34.95 
 
 
719 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  38.34 
 
 
741 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  38.54 
 
 
733 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  30.56 
 
 
734 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  34.47 
 
 
719 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  34.47 
 
 
719 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  34.98 
 
 
747 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  33.79 
 
 
753 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  35.08 
 
 
784 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  34.47 
 
 
719 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  34.47 
 
 
719 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  32.68 
 
 
720 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  34.48 
 
 
726 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  37.02 
 
 
742 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.48 
 
 
726 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  34.48 
 
 
726 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.48 
 
 
726 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.48 
 
 
726 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  36.84 
 
 
754 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.42 
 
 
726 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>