228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4589 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  61.81 
 
 
696 aa  770    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  99.15 
 
 
707 aa  1353    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
707 aa  1366    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  32.1 
 
 
688 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  35.71 
 
 
687 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.8 
 
 
701 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  39.03 
 
 
764 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.32 
 
 
478 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.6 
 
 
491 aa  237  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.37 
 
 
491 aa  228  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.84 
 
 
595 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 
734 aa  196  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  32.59 
 
 
572 aa  192  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  32.59 
 
 
572 aa  191  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.55 
 
 
509 aa  190  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.89 
 
 
537 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  29.17 
 
 
756 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 
745 aa  182  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.04 
 
 
748 aa  177  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  28.25 
 
 
750 aa  174  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  32.89 
 
 
737 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  28.4 
 
 
753 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 
548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.23 
 
 
739 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  27.58 
 
 
772 aa  163  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.51 
 
 
537 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.97 
 
 
756 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2874  lipopolysaccharide biosynthesis  31.4 
 
 
515 aa  158  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  25.75 
 
 
782 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  25.74 
 
 
758 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  26.21 
 
 
758 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.11 
 
 
751 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.32 
 
 
779 aa  148  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.7 
 
 
784 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.03 
 
 
785 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  27.72 
 
 
738 aa  145  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  29.67 
 
 
773 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 
764 aa  143  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.89 
 
 
778 aa  143  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  26.3 
 
 
788 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  25.56 
 
 
790 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.24 
 
 
753 aa  140  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  27.78 
 
 
715 aa  138  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
730 aa  138  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  28.66 
 
 
710 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.39 
 
 
737 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.03 
 
 
743 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.15 
 
 
704 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  29.4 
 
 
742 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.79 
 
 
718 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  27.05 
 
 
713 aa  130  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  27.44 
 
 
769 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
750 aa  127  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.71 
 
 
756 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  26.72 
 
 
776 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  27.74 
 
 
770 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  21.38 
 
 
756 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  27.09 
 
 
763 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.43 
 
 
755 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.92 
 
 
721 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
759 aa  112  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  23.45 
 
 
789 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 
766 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  27.15 
 
 
720 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 
731 aa  110  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 
737 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  28.44 
 
 
731 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.39 
 
 
727 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.29 
 
 
779 aa  105  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 
804 aa  105  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 
804 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  25.74 
 
 
872 aa  103  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 
774 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.79 
 
 
747 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.05 
 
 
711 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  25.78 
 
 
709 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  24.95 
 
 
771 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 
759 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  24.95 
 
 
789 aa  99.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.83 
 
 
576 aa  99  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.28 
 
 
726 aa  97.4  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  25.05 
 
 
466 aa  95.1  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  26.34 
 
 
475 aa  95.1  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 
731 aa  94.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  24.74 
 
 
472 aa  93.2  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 
726 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  27.99 
 
 
729 aa  92.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  21.57 
 
 
708 aa  90.1  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 
730 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 
738 aa  89.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 
724 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  26.32 
 
 
472 aa  88.2  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  21.75 
 
 
745 aa  87.8  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.38 
 
 
749 aa  87.8  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  21.77 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.22 
 
 
737 aa  84.3  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.73 
 
 
739 aa  84  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  22.37 
 
 
466 aa  83.6  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  20.37 
 
 
469 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  27.36 
 
 
735 aa  82  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>