205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0674 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 764 aa  1518    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.59 
 
 		 701 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 		 696 aa  264  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.38 
 
 		 707 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.38 
 
 		 707 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.15 
 
 		 595 aa  253  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.77 
 
 		 491 aa  243  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.76 
 
 		 491 aa  241  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  34 
 
 		 688 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  34.98 
 
 		 687 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  34.72 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  34.72 
 
 		 572 aa  219  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.91 
 
 		 478 aa  208  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 		 745 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.24 
 
 		 509 aa  197  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.24 
 
 		 748 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.28 
 
 		 548 aa  193  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.39 
 
 		 739 aa  190  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.71 
 
 		 537 aa  187  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.39 
 
 		 537 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  29.57 
 
 		 772 aa  185  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.69 
 
 		 756 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  32.29 
 
 		 753 aa  180  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  26.28 
 
 		 782 aa  177  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  30.73 
 
 		 756 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  31.38 
 
 		 737 aa  173  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2874  lipopolysaccharide biosynthesis  30.64 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.08 
 
 		 750 aa  167  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.51 
 
 		 718 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  29 
 
 		 758 aa  160  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.95 
 
 		 779 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  29.79 
 
 		 713 aa  154  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  28.54 
 
 		 758 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.41 
 
 		 734 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  29.18 
 
 		 750 aa  150  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  27.44 
 
 		 773 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.4 
 
 		 751 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  28.31 
 
 		 776 aa  146  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  28.33 
 
 		 788 aa  146  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.9 
 
 		 784 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  27.31 
 
 		 715 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  27.96 
 
 		 769 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  28.99 
 
 		 742 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  29.69 
 
 		 710 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.16 
 
 		 743 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 764 aa  134  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 		 704 aa  131  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  26.7 
 
 		 763 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.33 
 
 		 778 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 737 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 737 aa  125  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.83 
 
 		 779 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  27.22 
 
 		 729 aa  122  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.27 
 
 		 738 aa  120  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 		 726 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.8 
 
 		 766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.26 
 
 		 756 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 		 731 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 730 aa  115  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  26.75 
 
 		 720 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  26.08 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 785 aa  112  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  25.78 
 
 		 472 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.88 
 
 		 755 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  25.35 
 
 		 789 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  24.74 
 
 		 872 aa  111  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 724 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 804 aa  110  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 804 aa  110  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  25.54 
 
 		 790 aa  110  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 759 aa  108  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 738 aa  107  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  24.54 
 
 		 709 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 		 774 aa  105  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.95 
 
 		 772 aa  105  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  22.76 
 
 		 737 aa  104  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  22.72 
 
 		 770 aa  103  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.9 
 
 		 747 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0359  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  27.33 
 
 		 720 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.302004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 467 aa  100  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  24.11 
 
 		 797 aa  100  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  23.03 
 
 		 466 aa  99  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.76 
 
 		 734 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  25.22 
 
 		 771 aa  97.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  25.22 
 
 		 789 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  23.14 
 
 		 753 aa  96.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  26.39 
 
 		 731 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.27 
 
 		 727 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.85 
 
 		 759 aa  95.5  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  24.81 
 
 		 735 aa  94.7  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 730 aa  94.4  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 731 aa  93.6  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.18 
 
 		 711 aa  93.2  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  26.42 
 
 		 475 aa  92.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  22.53 
 
 		 726 aa  91.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  21.23 
 
 		 756 aa  91.3  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0243  lipopolysaccharide biosynthesis  25.34 
 
 		 463 aa  89  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.87 
 
 		 722 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  23.54 
 
 		 469 aa  87.4  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  23.78 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>