More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0861 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
536 aa  1087    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 
563 aa  200  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.274644  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4548  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.2 
 
 
554 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.84 
 
 
739 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  32.67 
 
 
756 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 
588 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  29.63 
 
 
758 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  28.96 
 
 
758 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  27.59 
 
 
782 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.03 
 
 
750 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  27.39 
 
 
790 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  24.36 
 
 
529 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
588 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  24.76 
 
 
521 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.15 
 
 
748 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  29.62 
 
 
779 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  26.39 
 
 
745 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.41 
 
 
720 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.76 
 
 
778 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3533  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 
320 aa  100  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.44 
 
 
779 aa  100  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  28.53 
 
 
756 aa  99.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 
764 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.68 
 
 
785 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  29.31 
 
 
722 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.83 
 
 
772 aa  97.1  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  29.29 
 
 
492 aa  96.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  26.35 
 
 
734 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  29.05 
 
 
788 aa  95.1  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  26.26 
 
 
753 aa  94  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  22.19 
 
 
464 aa  94  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
524 aa  93.2  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  29.59 
 
 
756 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  29.29 
 
 
472 aa  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  27.08 
 
 
735 aa  91.7  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  26.85 
 
 
496 aa  90.9  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 
745 aa  90.9  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  27.42 
 
 
733 aa  90.5  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  26.12 
 
 
750 aa  90.5  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.14 
 
 
482 aa  90.1  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 
750 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.32 
 
 
730 aa  90.1  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.78 
 
 
743 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  30.46 
 
 
718 aa  89.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  29.41 
 
 
736 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  28.44 
 
 
872 aa  87.8  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.65 
 
 
753 aa  87.4  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  29.7 
 
 
233 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  26.76 
 
 
789 aa  87  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  27.72 
 
 
484 aa  87  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.41 
 
 
235 aa  87  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.33 
 
 
770 aa  87  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  30.2 
 
 
233 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.2 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  24.65 
 
 
738 aa  84.7  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  30.05 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.4 
 
 
751 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  30.2 
 
 
233 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  29.8 
 
 
772 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  29.21 
 
 
233 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  28.48 
 
 
477 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  29.7 
 
 
233 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.59 
 
 
225 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  26.73 
 
 
246 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
737 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.24 
 
 
724 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  27.5 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  28.57 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  27.08 
 
 
742 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  28.57 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28.63 
 
 
790 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 
738 aa  80.1  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  26.73 
 
 
755 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  25.13 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  25.25 
 
 
710 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  24.23 
 
 
527 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  22.99 
 
 
667 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  26.86 
 
 
747 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  27.78 
 
 
771 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 
576 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.58 
 
 
741 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  32.41 
 
 
776 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.58 
 
 
741 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.58 
 
 
741 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  28.17 
 
 
225 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  30.35 
 
 
751 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  25.79 
 
 
539 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  27.59 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  25.45 
 
 
740 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  27.49 
 
 
755 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  28.12 
 
 
778 aa  77.4  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.09 
 
 
734 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  28.24 
 
 
789 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  23.4 
 
 
759 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.16 
 
 
463 aa  77  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  24.68 
 
 
753 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  26.6 
 
 
257 aa  77  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.06 
 
 
741 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>