More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3405 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  82.54 
 
 		 588 aa  954    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 588 aa  1179    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 563 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.274644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  29.17 
 
 		 772 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  28.49 
 
 		 756 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 536 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 745 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.1 
 
 		 778 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  28.12 
 
 		 788 aa  103  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  27.02 
 
 		 782 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  27.41 
 
 		 776 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  28.06 
 
 		 758 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  26.65 
 
 		 758 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 785 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  26.54 
 
 		 790 aa  98.2  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.58 
 
 		 739 aa  95.9  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  26.87 
 
 		 496 aa  93.2  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  28.57 
 
 		 753 aa  89.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  24.13 
 
 		 741 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 		 764 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4548  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 554 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 505 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 576 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  26.53 
 
 		 739 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  26.53 
 
 		 739 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.21 
 
 		 739 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  26.28 
 
 		 739 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  23.45 
 
 		 736 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 		 728 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 750 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.28 
 
 		 734 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.77 
 
 		 711 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  26.3 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  24.02 
 
 		 744 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.38 
 
 		 779 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 751 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  26.26 
 
 		 736 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.96 
 
 		 720 aa  78.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  23.58 
 
 		 789 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.92 
 
 		 741 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.57 
 
 		 575 aa  77  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  27.65 
 
 		 508 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  23.96 
 
 		 744 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 761 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 730 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.07 
 
 		 741 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  24.11 
 
 		 755 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.93 
 
 		 779 aa  74.7  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  25.04 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  23.96 
 
 		 744 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  26.43 
 
 		 734 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.34 
 
 		 741 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1010  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 599 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.41 
 
 		 730 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.34 
 
 		 741 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.34 
 
 		 741 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  25.84 
 
 		 466 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  30.59 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.76 
 
 		 217 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  29.76 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  23.05 
 
 		 741 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.05 
 
 		 741 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  28.89 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  24.35 
 
 		 740 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.04 
 
 		 756 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.49 
 
 		 738 aa  70.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 748 aa  70.5  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  28.77 
 
 		 745 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  24.29 
 
 		 740 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.22 
 
 		 790 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  22.65 
 
 		 747 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  23.88 
 
 		 529 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.81 
 
 		 770 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  23.95 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  23.44 
 
 		 764 aa  68.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.24 
 
 		 751 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.64 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  24.34 
 
 		 732 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 751 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4573  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 662 aa  67.4  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  26.44 
 
 		 509 aa  67  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  22.83 
 
 		 746 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  24.91 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.55 
 
 		 772 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.85 
 
 		 720 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  24.31 
 
 		 790 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  28.89 
 
 		 217 aa  66.2  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  22.46 
 
 		 735 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  32.74 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  22.36 
 
 		 759 aa  64.7  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.55 
 
 		 722 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2022  chromosome partitioning ATPase  26.5 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.14 
 
 		 806 aa  64.3  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 710 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  28.65 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.7 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>