193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1457 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 576 aa  1152    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.46 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  31.98 
 
 		 687 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.67 
 
 		 696 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  31.53 
 
 		 688 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 		 745 aa  95.9  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  27.25 
 
 		 790 aa  94  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 		 588 aa  93.6  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.87 
 
 		 701 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  28.95 
 
 		 756 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  27.35 
 
 		 734 aa  91.3  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  28.21 
 
 		 753 aa  90.9  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.4 
 
 		 491 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 		 563 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.274644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  28.7 
 
 		 772 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  28.87 
 
 		 756 aa  86.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  28.33 
 
 		 750 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.18 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.01 
 
 		 739 aa  83.6  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 707 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 588 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.43 
 
 		 748 aa  82.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 707 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.66 
 
 		 750 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 536 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  31.52 
 
 		 782 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  27.69 
 
 		 776 aa  78.2  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 		 595 aa  77  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  26.61 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.67 
 
 		 779 aa  74.3  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  26.61 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  29.71 
 
 		 764 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  27.8 
 
 		 770 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  25.82 
 
 		 742 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  26.04 
 
 		 756 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.93 
 
 		 758 aa  70.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 		 774 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 		 548 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  26.32 
 
 		 773 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  30.43 
 
 		 789 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 764 aa  67.8  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.04 
 
 		 738 aa  67  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.75 
 
 		 537 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 730 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 728 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.4 
 
 		 778 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 784 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  24.73 
 
 		 713 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.4 
 
 		 711 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  26.3 
 
 		 709 aa  65.1  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  26.96 
 
 		 758 aa  64.7  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  29.38 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 		 759 aa  63.9  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 715 aa  63.9  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 718 aa  63.9  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  30.22 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  28.89 
 
 		 755 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 804 aa  62  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 804 aa  62  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.95 
 
 		 704 aa  61.6  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 731 aa  61.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  25.28 
 
 		 779 aa  60.5  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2874  lipopolysaccharide biosynthesis  26.64 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 776 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 751 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.89 
 
 		 788 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  22.32 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.82 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 766 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.92 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  24.4 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.21 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.21 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.21 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  25.59 
 
 		 763 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.51 
 
 		 743 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  24.46 
 
 		 872 aa  57.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.04 
 
 		 756 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.32 
 
 		 741 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  27.89 
 
 		 721 aa  57.4  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  31.21 
 
 		 736 aa  57  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.32 
 
 		 741 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  23.72 
 
 		 475 aa  57  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 		 749 aa  56.6  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  28.64 
 
 		 771 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3533  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 320 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.84 
 
 		 720 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  28.64 
 
 		 789 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 785 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  24.73 
 
 		 769 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  21 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 		 759 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  34.29 
 
 		 503 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 737 aa  53.9  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.56 
 
 		 575 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  23.33 
 
 		 803 aa  53.9  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  28.72 
 
 		 721 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.71 
 
 		 727 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>