More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4573 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4573  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 662 aa  1357    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  23.14 
 
 		 738 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  23.8 
 
 		 734 aa  105  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4548  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 554 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  27.36 
 
 		 496 aa  84.3  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  28.15 
 
 		 741 aa  83.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  26.54 
 
 		 454 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 738 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  26.35 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.98 
 
 		 720 aa  81.6  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.91 
 
 		 739 aa  80.9  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.12 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.92 
 
 		 745 aa  80.9  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  25.96 
 
 		 667 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 737 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.26 
 
 		 736 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  27.62 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  28.01 
 
 		 758 aa  79  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  24.43 
 
 		 748 aa  78.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  25.75 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 735 aa  78.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  20.93 
 
 		 746 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  24.92 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  25.08 
 
 		 736 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  22.97 
 
 		 756 aa  77.8  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.85 
 
 		 751 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.59 
 
 		 756 aa  77.8  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  21.74 
 
 		 764 aa  77.8  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  24.17 
 
 		 753 aa  77.4  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  26.28 
 
 		 750 aa  77  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  28.48 
 
 		 443 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  28.48 
 
 		 497 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  22.71 
 
 		 739 aa  76.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  23.75 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  25.39 
 
 		 747 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 750 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  21.86 
 
 		 741 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.13 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25.34 
 
 		 750 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.45 
 
 		 741 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.91 
 
 		 778 aa  74.7  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.45 
 
 		 741 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  29.45 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.54 
 
 		 575 aa  73.9  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  22.93 
 
 		 757 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.47 
 
 		 734 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  23.53 
 
 		 740 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  21.79 
 
 		 743 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  26.83 
 
 		 509 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  28.3 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  22.64 
 
 		 740 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  24.19 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  23.23 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.22 
 
 		 755 aa  72.4  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.33 
 
 		 756 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25.25 
 
 		 727 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  22.41 
 
 		 741 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.57 
 
 		 772 aa  71.6  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  28.76 
 
 		 758 aa  72  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 804 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  23.14 
 
 		 763 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  24.67 
 
 		 774 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  26.21 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  22.17 
 
 		 741 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  22.17 
 
 		 741 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.17 
 
 		 741 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.57 
 
 		 711 aa  70.5  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 588 aa  70.5  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  21.58 
 
 		 739 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 588 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  26.1 
 
 		 718 aa  69.7  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.41 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  26.1 
 
 		 797 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.2 
 
 		 722 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  23.02 
 
 		 753 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.83 
 
 		 753 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  22.46 
 
 		 780 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  25.28 
 
 		 624 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  21.28 
 
 		 739 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  22.51 
 
 		 790 aa  68.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  21.28 
 
 		 739 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  22.85 
 
 		 740 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  22.37 
 
 		 755 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  21.06 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  22.16 
 
 		 751 aa  67  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  23.59 
 
 		 753 aa  67  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  23.41 
 
 		 745 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  25.47 
 
 		 615 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.91 
 
 		 724 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  23.16 
 
 		 727 aa  66.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  22.26 
 
 		 732 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 		 759 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  24.77 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.5 
 
 		 739 aa  65.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  22.56 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  23.46 
 
 		 727 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 		 749 aa  65.1  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>