More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1010 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1010  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 599 aa  1191    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0949  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.98 
 
 		 561 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 		 496 aa  97.8  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  27.48 
 
 		 722 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  25.05 
 
 		 505 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1011  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3967  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.51 
 
 		 852 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  27.42 
 
 		 747 aa  87.4  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8590  hypothetical protein  34.73 
 
 		 425 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  24.09 
 
 		 667 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  29.51 
 
 		 624 aa  84.3  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  30 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  28.79 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  27.69 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  27.86 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  31.82 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  24.84 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  28.19 
 
 		 743 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  30.48 
 
 		 266 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.8 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  28.28 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 804 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.2 
 
 		 721 aa  77  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  27.53 
 
 		 275 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  28.63 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  30.58 
 
 		 211 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  28.04 
 
 		 529 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  28.33 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  24.73 
 
 		 753 aa  74.3  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 730 aa  73.9  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.35 
 
 		 240 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  31 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.03 
 
 		 751 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  29.18 
 
 		 755 aa  73.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  31.53 
 
 		 246 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 588 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  31.36 
 
 		 781 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.97 
 
 		 575 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.36 
 
 		 780 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  28.9 
 
 		 755 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2732  tyrosine kinase  30.04 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.78 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  28.87 
 
 		 803 aa  70.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0748  XRE family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  29.78 
 
 		 711 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28 
 
 		 790 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.72 
 
 		 734 aa  70.5  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  22.87 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.26 
 
 		 281 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  25.54 
 
 		 746 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  26.38 
 
 		 764 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  27.67 
 
 		 778 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  23.67 
 
 		 753 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  28.01 
 
 		 733 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.1 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  22.79 
 
 		 721 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  31.4 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  27.31 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  23.75 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.8 
 
 		 734 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  29.33 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.94 
 
 		 779 aa  67.8  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.36 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  28.1 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  26.64 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.78 
 
 		 250 aa  67  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  28.99 
 
 		 738 aa  67  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  27.49 
 
 		 747 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  27.31 
 
 		 747 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  25.85 
 
 		 736 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.47 
 
 		 778 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  28.02 
 
 		 790 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0150  hypothetical protein  30.23 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  23.94 
 
 		 746 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.61 
 
 		 739 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  26.54 
 
 		 746 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  23.94 
 
 		 746 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.51 
 
 		 745 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.64 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  23.97 
 
 		 724 aa  65.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  28.89 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.22 
 
 		 760 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  34.92 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.02 
 
 		 756 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  26.53 
 
 		 822 aa  65.1  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2024  protein-tyrosine kinase  28.17 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.607078  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  23.68 
 
 		 786 aa  64.7  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  29.12 
 
 		 814 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  25.65 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  28.69 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  27.9 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.31 
 
 		 800 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.78 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  25.08 
 
 		 723 aa  63.9  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 778 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  26.91 
 
 		 739 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  24.45 
 
 		 727 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>