More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1447 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 		 392 aa  795    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  71.55 
 
 		 330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  46.07 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  42.23 
 
 		 281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  42.41 
 
 		 275 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  45.03 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  37.39 
 
 		 282 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  38.38 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  33.77 
 
 		 293 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  34.15 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  40.31 
 
 		 266 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  34.55 
 
 		 268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  34.55 
 
 		 268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  34.09 
 
 		 268 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  33.64 
 
 		 268 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  37.22 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.56 
 
 		 298 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  36.52 
 
 		 294 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  36.18 
 
 		 284 aa  133  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  35.96 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  31.02 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.66 
 
 		 257 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  36.41 
 
 		 323 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  39.67 
 
 		 265 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  34.85 
 
 		 299 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  34.17 
 
 		 332 aa  117  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  35.32 
 
 		 288 aa  117  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  33.17 
 
 		 318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.6 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  31.12 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 		 250 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.83 
 
 		 299 aa  113  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  36.78 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  41.57 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  39.69 
 
 		 211 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.84 
 
 		 305 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  32.65 
 
 		 232 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.87 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  33.17 
 
 		 217 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.17 
 
 		 217 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  38.54 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  32.81 
 
 		 246 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.82 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  36.18 
 
 		 484 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  30.22 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.54 
 
 		 730 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.08 
 
 		 215 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  28.7 
 
 		 259 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  31.44 
 
 		 737 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  32.65 
 
 		 233 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  33.16 
 
 		 233 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  33.85 
 
 		 205 aa  99.8  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  37.19 
 
 		 233 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  33.67 
 
 		 233 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  38.86 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 605 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  34.9 
 
 		 496 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  32.14 
 
 		 233 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  32.65 
 
 		 233 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  36.04 
 
 		 224 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  31.77 
 
 		 790 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  34.34 
 
 		 624 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.57 
 
 		 751 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 		 234 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.66 
 
 		 306 aa  97.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  34.62 
 
 		 261 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  33.33 
 
 		 225 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.9 
 
 		 454 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  32.81 
 
 		 221 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  38.86 
 
 		 525 aa  96.3  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  31.94 
 
 		 509 aa  96.3  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  32.37 
 
 		 726 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.28 
 
 		 464 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  33.01 
 
 		 746 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  34.17 
 
 		 756 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  29.21 
 
 		 767 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  33.17 
 
 		 252 aa  95.9  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.82 
 
 		 575 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  32.82 
 
 		 257 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  36.87 
 
 		 503 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  32.82 
 
 		 225 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  35.9 
 
 		 244 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  32.82 
 
 		 225 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  31.11 
 
 		 508 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  30.29 
 
 		 735 aa  92.4  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  34.72 
 
 		 753 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  30.93 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  34.15 
 
 		 733 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  30.93 
 
 		 497 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  33.84 
 
 		 492 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  29.9 
 
 		 505 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  28.87 
 
 		 806 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  34.39 
 
 		 778 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  25.98 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.85 
 
 		 730 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  31.77 
 
 		 472 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  30.1 
 
 		 804 aa  90.1  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  32.12 
 
 		 754 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.12 
 
 		 242 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  34.39 
 
 		 776 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>