More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2390 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 
284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  45.16 
 
 
305 aa  221  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  47.14 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  46.7 
 
 
318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  45.99 
 
 
297 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  44.76 
 
 
323 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  45.53 
 
 
297 aa  209  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  41.47 
 
 
323 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  46.67 
 
 
332 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  39.68 
 
 
299 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  44 
 
 
314 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  41.15 
 
 
257 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  44.1 
 
 
288 aa  188  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  46.34 
 
 
265 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  41.56 
 
 
330 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  42.01 
 
 
299 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  41.6 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.76 
 
 
306 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  34.18 
 
 
373 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  40.67 
 
 
266 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  43 
 
 
283 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  38.76 
 
 
330 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  39.39 
 
 
281 aa  142  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  38.68 
 
 
282 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  40.09 
 
 
294 aa  136  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  39.62 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  36.18 
 
 
392 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  34.59 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  38.12 
 
 
275 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.47 
 
 
298 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  39.41 
 
 
295 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.06 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  36.93 
 
 
295 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  34.92 
 
 
749 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0748  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  33.77 
 
 
804 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  37.5 
 
 
454 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  33.05 
 
 
734 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  32.68 
 
 
719 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  32.68 
 
 
719 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.95 
 
 
217 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  31.2 
 
 
268 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  32.68 
 
 
719 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  36.9 
 
 
753 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  36.36 
 
 
735 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  35.38 
 
 
496 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  33.49 
 
 
217 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  32.3 
 
 
719 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  31.91 
 
 
719 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  31.47 
 
 
252 aa  105  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  31.91 
 
 
720 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  31.91 
 
 
720 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  32.3 
 
 
720 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  32.68 
 
 
720 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  31.91 
 
 
720 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  31.91 
 
 
720 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  36.84 
 
 
751 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.56 
 
 
225 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  31.91 
 
 
720 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  31.91 
 
 
720 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  36.07 
 
 
756 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  31.46 
 
 
233 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  33.88 
 
 
233 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  35.6 
 
 
667 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  34.9 
 
 
727 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  32.31 
 
 
739 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  32.31 
 
 
739 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  33.88 
 
 
233 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
268 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  37.97 
 
 
257 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  32.31 
 
 
739 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
268 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  32.79 
 
 
233 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
747 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  35.26 
 
 
802 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  32.78 
 
 
268 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  37.97 
 
 
225 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  36.93 
 
 
759 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  37.56 
 
 
472 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  33.33 
 
 
233 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  34.03 
 
 
720 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  37.08 
 
 
438 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  31.79 
 
 
739 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  32.28 
 
 
745 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  34.74 
 
 
747 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  36.9 
 
 
225 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.17 
 
 
737 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  33.78 
 
 
225 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  35.75 
 
 
731 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  36.9 
 
 
225 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  33.51 
 
 
734 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 
234 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  31.75 
 
 
746 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2965  chromosome partitioning ATPase  31.13 
 
 
309 aa  99.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  37.17 
 
 
453 aa  99.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.46 
 
 
730 aa  99  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  31.03 
 
 
721 aa  98.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  33.51 
 
 
721 aa  98.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  33.5 
 
 
232 aa  98.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  34.44 
 
 
784 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>