More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02601 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 299 aa  610  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  56.79 
 
 		 299 aa  322  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  56.33 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  44.4 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  38.85 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  46.08 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  42.8 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  37.37 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  40.27 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  37.2 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  45.64 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  40.85 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  43.67 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  38.52 
 
 		 332 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  39.08 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  41.48 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  34.17 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  34.6 
 
 		 373 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  40.85 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  42.08 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  40.37 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  40.37 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.77 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  34.73 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  38.94 
 
 		 275 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  36.49 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  36.91 
 
 		 266 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.78 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  35.33 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  32.61 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  33.94 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.52 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  32.83 
 
 		 392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  34.72 
 
 		 751 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  34.33 
 
 		 720 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.64 
 
 		 496 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  32.78 
 
 		 503 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  35.84 
 
 		 802 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  33.17 
 
 		 720 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  32.66 
 
 		 720 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  32.66 
 
 		 720 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  32.66 
 
 		 720 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  32.66 
 
 		 720 aa  102  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  33.5 
 
 		 719 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  32.66 
 
 		 720 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  32.99 
 
 		 719 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  36.31 
 
 		 438 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  32.99 
 
 		 719 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  32.99 
 
 		 719 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  32.99 
 
 		 719 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.41 
 
 		 800 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.03 
 
 		 524 aa  99.8  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  32.16 
 
 		 720 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  32.16 
 
 		 720 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.16 
 
 		 804 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  31.96 
 
 		 727 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  31.19 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  35.84 
 
 		 790 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  31.96 
 
 		 232 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  35.37 
 
 		 746 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  35.37 
 
 		 746 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  35.37 
 
 		 746 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.51 
 
 		 217 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 		 453 aa  96.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  32.93 
 
 		 744 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  32.93 
 
 		 721 aa  96.3  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  29.95 
 
 		 753 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.79 
 
 		 737 aa  95.9  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  31.78 
 
 		 217 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  30.29 
 
 		 233 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  31.71 
 
 		 744 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  34.76 
 
 		 746 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.86 
 
 		 463 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.83 
 
 		 454 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  29.95 
 
 		 735 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  30.85 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  30.29 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  32.32 
 
 		 745 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  31.09 
 
 		 734 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  29.88 
 
 		 233 aa  92.8  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  32.93 
 
 		 739 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  32.93 
 
 		 745 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0748  XRE family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 242 aa  92.8  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  32.93 
 
 		 739 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  32.93 
 
 		 739 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  29.29 
 
 		 734 aa  92.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2965  chromosome partitioning ATPase  29.18 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  31.82 
 
 		 667 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  30.17 
 
 		 233 aa  92  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  35.82 
 
 		 484 aa  92.4  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.41 
 
 		 464 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  29.54 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1658  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  30.93 
 
 		 764 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  34.1 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  31.61 
 
 		 784 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  32.32 
 
 		 745 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  32.93 
 
 		 739 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  29.44 
 
 		 749 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 		 743 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>