More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2583 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  100 
 
 		 295 aa  598  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  41.22 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  46.07 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  44.5 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  33.59 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  44.19 
 
 		 275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.76 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  33.18 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  33.18 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  33.18 
 
 		 268 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  31.19 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  40.7 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  39.69 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  38.6 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.57 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.94 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  34.86 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  36.31 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  39.77 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  30.56 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  36.6 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  38.6 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  36.93 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  29.83 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.34 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  31.02 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.42 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  30.7 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  31.67 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  28.19 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  31.73 
 
 		 232 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0748  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  36.57 
 
 		 503 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  35 
 
 		 605 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 737 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  30.47 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.5 
 
 		 720 aa  96.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  36.57 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  37.36 
 
 		 438 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  35 
 
 		 624 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32.66 
 
 		 496 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  36.26 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  33.51 
 
 		 790 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  36.17 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  30.77 
 
 		 233 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.96 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  35.96 
 
 		 741 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  30.29 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  29.81 
 
 		 233 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  36.46 
 
 		 484 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  29.81 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  29.81 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2410  exopolysaccharide biosynthesis domain-containing protein  32.82 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  36.17 
 
 		 776 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  30.73 
 
 		 205 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.33 
 
 		 234 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.19 
 
 		 220 aa  89  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.75 
 
 		 750 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  30.43 
 
 		 221 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  33 
 
 		 803 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  31.5 
 
 		 249 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  36.57 
 
 		 492 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 217 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  28.37 
 
 		 474 aa  86.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.67 
 
 		 217 aa  86.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  29.41 
 
 		 217 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  33.85 
 
 		 753 aa  85.5  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  34.18 
 
 		 211 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  32.95 
 
 		 684 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  31.37 
 
 		 803 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.74 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.87 
 
 		 524 aa  84.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  33.16 
 
 		 766 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  31.15 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  32.65 
 
 		 735 aa  84  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  31.4 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  30.77 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  32.67 
 
 		 756 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  31.84 
 
 		 782 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  29.31 
 
 		 770 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  31.6 
 
 		 615 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  28.87 
 
 		 778 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  33.16 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.81 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.81 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  31.44 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  31.44 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.06 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  33.33 
 
 		 743 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.06 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  31.73 
 
 		 734 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3389  chromosome partitioning ATPase  28.12 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.47 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  26.76 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  32.57 
 
 		 727 aa  79  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.3 
 
 		 575 aa  79  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  26.54 
 
 		 763 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>