More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0586 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
288 aa  579  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  52.56 
 
 
314 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  50 
 
 
323 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  48.68 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  49.56 
 
 
323 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  55.98 
 
 
265 aa  209  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  49.56 
 
 
318 aa  208  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  47.72 
 
 
297 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  49.12 
 
 
332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  48.56 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  44.1 
 
 
284 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  45.61 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  43.42 
 
 
297 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  41.85 
 
 
299 aa  178  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  43.57 
 
 
299 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  43.42 
 
 
373 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  41.08 
 
 
335 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  39.92 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  42.19 
 
 
306 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  40.89 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  35.89 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  39.46 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  40 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.8 
 
 
281 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  35.78 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.62 
 
 
298 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  32.67 
 
 
293 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  36.45 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  35.32 
 
 
392 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  36.81 
 
 
330 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  37.44 
 
 
295 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  32.39 
 
 
261 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  32.42 
 
 
295 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  29.95 
 
 
737 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  34.15 
 
 
776 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.96 
 
 
496 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  33.14 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  34.78 
 
 
745 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  32.63 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  33.04 
 
 
225 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  33.14 
 
 
268 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  32.98 
 
 
521 aa  92.4  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.36 
 
 
524 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  33.18 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  33.14 
 
 
268 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  34.3 
 
 
472 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  33.14 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  33.9 
 
 
790 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.75 
 
 
454 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  31.94 
 
 
474 aa  89  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  31.72 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  31.28 
 
 
225 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  31.86 
 
 
734 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  31 
 
 
233 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  34.69 
 
 
778 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.84 
 
 
804 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.41 
 
 
240 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.55 
 
 
575 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 
738 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  33.5 
 
 
720 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 
250 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  29.55 
 
 
778 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  33.19 
 
 
667 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  30.57 
 
 
756 aa  85.5  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.36 
 
 
726 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  32.39 
 
 
211 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.57 
 
 
217 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  38.29 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.12 
 
 
730 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  33.5 
 
 
784 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  32.09 
 
 
484 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  32.97 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  30.8 
 
 
503 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  32.45 
 
 
529 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  33.16 
 
 
233 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2965  chromosome partitioning ATPase  31.63 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  30.7 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  32.82 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  32.31 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  31.65 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  33.5 
 
 
764 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  27.6 
 
 
755 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  33.9 
 
 
788 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  32.14 
 
 
229 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  35.68 
 
 
525 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.65 
 
 
464 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  32.11 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.63 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.68 
 
 
750 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.99 
 
 
779 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
615 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  32.54 
 
 
766 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  31.66 
 
 
736 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  31.68 
 
 
720 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  31.96 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  31.68 
 
 
720 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  31.68 
 
 
720 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  32.18 
 
 
720 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.37 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>