More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2527 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  100 
 
 
265 aa  530  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  50.53 
 
 
306 aa  277  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  49.45 
 
 
314 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  51.11 
 
 
332 aa  255  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  49.44 
 
 
323 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  46.79 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  49.63 
 
 
297 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  45.45 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  46.89 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  55.98 
 
 
288 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  41.95 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  46.34 
 
 
284 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  40.82 
 
 
299 aa  188  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  46.88 
 
 
257 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  44.44 
 
 
335 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  41.48 
 
 
299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  41.35 
 
 
330 aa  162  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  42.35 
 
 
373 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  40.36 
 
 
306 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  40.22 
 
 
392 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  40.61 
 
 
283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  41.08 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  37.44 
 
 
281 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  41.38 
 
 
330 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  39.46 
 
 
282 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  38.92 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  40.35 
 
 
293 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  36.82 
 
 
275 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  37.14 
 
 
294 aa  118  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  36.67 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  37.44 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  36.02 
 
 
295 aa  99.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  34.52 
 
 
225 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  34.21 
 
 
232 aa  95.5  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  34.2 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.5 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  34.01 
 
 
225 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  30.77 
 
 
252 aa  94  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  34.74 
 
 
737 aa  93.6  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  32.69 
 
 
233 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  31.63 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  34.31 
 
 
734 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  32.49 
 
 
257 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  33.68 
 
 
233 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  37.18 
 
 
784 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  40 
 
 
525 aa  89.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  33.68 
 
 
233 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  32.64 
 
 
233 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.15 
 
 
235 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  32.32 
 
 
740 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.16 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  30.51 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.8 
 
 
240 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  39.38 
 
 
758 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  31.71 
 
 
732 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  33.16 
 
 
814 aa  85.9  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  31.93 
 
 
268 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  39.38 
 
 
758 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  31.93 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.65 
 
 
730 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.27 
 
 
217 aa  85.1  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.18 
 
 
800 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  33.16 
 
 
585 aa  85.1  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
795 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  33.54 
 
 
739 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  30.95 
 
 
803 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  32.93 
 
 
741 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.51 
 
 
454 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  29.73 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  33.54 
 
 
739 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  33.54 
 
 
739 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  30.43 
 
 
790 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.32 
 
 
741 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.66 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  31.33 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  32.32 
 
 
741 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  36.36 
 
 
795 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  30.93 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  29.8 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  32.98 
 
 
819 aa  82.4  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  32.46 
 
 
803 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2965  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.93 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  33.51 
 
 
474 aa  82  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  31.32 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.02 
 
 
230 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0748  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.02 
 
 
230 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  34.57 
 
 
766 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.32 
 
 
741 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  32.08 
 
 
735 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  34.54 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  31.53 
 
 
756 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  32.32 
 
 
741 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  32.32 
 
 
741 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  36.48 
 
 
800 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  32.32 
 
 
739 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  35.81 
 
 
764 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  42.76 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>