More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1983 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  100 
 
 
297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  48.1 
 
 
306 aa  216  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  42.05 
 
 
297 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  43.39 
 
 
318 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  45.34 
 
 
323 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  46.49 
 
 
284 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  42.32 
 
 
314 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  41.78 
 
 
332 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  40 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  39.85 
 
 
305 aa  195  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  45.05 
 
 
299 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  41.06 
 
 
299 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  41.95 
 
 
265 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  43.89 
 
 
257 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  40.17 
 
 
335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  43.17 
 
 
288 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  38.4 
 
 
330 aa  166  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  37.45 
 
 
283 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  35.97 
 
 
306 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  39.56 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  35.54 
 
 
373 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.65 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  35.4 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  32.52 
 
 
275 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  32.7 
 
 
294 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  35.96 
 
 
392 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  34.62 
 
 
330 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  28.52 
 
 
293 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.22 
 
 
250 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  38.41 
 
 
295 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.87 
 
 
298 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  33.03 
 
 
232 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  34.78 
 
 
225 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  32.8 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  34.35 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  34.35 
 
 
225 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.04 
 
 
225 aa  96.3  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  36.57 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  32.17 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.08 
 
 
737 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  32.02 
 
 
233 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  31.76 
 
 
730 aa  93.2  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  31.58 
 
 
233 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  32.02 
 
 
233 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  32.5 
 
 
257 aa  92.4  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  30.7 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  33.04 
 
 
244 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  32.91 
 
 
734 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  34.63 
 
 
722 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  31.14 
 
 
233 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.17 
 
 
496 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.7 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  34.27 
 
 
784 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  35.98 
 
 
490 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  29.44 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2965  chromosome partitioning ATPase  28.78 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.34 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.5 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  30.41 
 
 
741 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.12 
 
 
726 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.41 
 
 
741 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  32.14 
 
 
764 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  31.3 
 
 
259 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  32.62 
 
 
744 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  30.05 
 
 
529 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  30.59 
 
 
727 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  29.9 
 
 
741 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.86 
 
 
779 aa  82.8  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  33.72 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  33.72 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  31.82 
 
 
790 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  32.52 
 
 
789 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  30.15 
 
 
750 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.38 
 
 
741 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  29.38 
 
 
741 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.09 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  33.72 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  29.38 
 
 
741 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  27.39 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  29.95 
 
 
605 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  32.19 
 
 
744 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  33.75 
 
 
788 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  28 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  32.56 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  34.68 
 
 
756 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  30.67 
 
 
753 aa  79.3  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  28.29 
 
 
780 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  35.57 
 
 
778 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.43 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30.91 
 
 
739 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  28.81 
 
 
747 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30.91 
 
 
739 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  30.91 
 
 
739 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  32.58 
 
 
784 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  30.43 
 
 
741 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.43 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.7 
 
 
220 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  30.91 
 
 
739 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  29.2 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>