More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2507 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  62.42 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  58.97 
 
 		 332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  50.72 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  48.2 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  46.42 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  49.63 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  51.05 
 
 		 323 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  45.1 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  42.07 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  42.25 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  48.2 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.37 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  42.92 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  42.15 
 
 		 373 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  36.8 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  38.58 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  40.34 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  42.52 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.6 
 
 		 282 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.19 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  34.87 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  36.52 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.62 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  35.87 
 
 		 294 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.44 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  35.59 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  36.78 
 
 		 392 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  31.16 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  34.86 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  41.07 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  30.47 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 268 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.62 
 
 		 454 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  36.22 
 
 		 804 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  36.26 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32.79 
 
 		 496 aa  94  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  30.41 
 
 		 252 aa  92.4  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.03 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.99 
 
 		 240 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  35.2 
 
 		 737 aa  89  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.44 
 
 		 220 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  33.49 
 
 		 751 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.85 
 
 		 575 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0748  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 242 aa  86.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  29.55 
 
 		 232 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  29.91 
 
 		 790 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  33.5 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.6 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  30.04 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  31.73 
 
 		 726 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  36.12 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  34.76 
 
 		 731 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  29.6 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.34 
 
 		 741 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  32.06 
 
 		 615 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  31.34 
 
 		 741 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  27.23 
 
 		 721 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.51 
 
 		 739 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  32.94 
 
 		 503 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  32.93 
 
 		 721 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  29.52 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  30.48 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  28.16 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  27.73 
 
 		 464 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2965  chromosome partitioning ATPase  29.69 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.55 
 
 		 730 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  30.77 
 
 		 741 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  30.8 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  31.09 
 
 		 734 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  25.39 
 
 		 772 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  31.38 
 
 		 734 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  32.16 
 
 		 737 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  30.81 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  33.74 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  33.64 
 
 		 790 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.15 
 
 		 741 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  36.36 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.39 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  31.35 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  31.89 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.66 
 
 		 730 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37 
 
 		 750 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  27.55 
 
 		 740 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  30 
 
 		 739 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30 
 
 		 739 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  29.39 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30 
 
 		 739 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  29 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  31.9 
 
 		 443 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  30 
 
 		 784 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  38.32 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.85 
 
 		 741 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  31.9 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  24.49 
 
 		 751 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  29.85 
 
 		 741 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>