More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0146 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  61.64 
 
 
297 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  62.03 
 
 
332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  55.88 
 
 
306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  45.43 
 
 
305 aa  248  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  50.88 
 
 
323 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  46.51 
 
 
314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  50.66 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  46.79 
 
 
265 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  46.7 
 
 
284 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  42.86 
 
 
297 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  49.56 
 
 
288 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  42.29 
 
 
330 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  38.72 
 
 
299 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.58 
 
 
299 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  43.21 
 
 
373 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  44.4 
 
 
335 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  42.73 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  45.42 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  34.41 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  35.41 
 
 
281 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  33.45 
 
 
294 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.38 
 
 
282 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  34.07 
 
 
294 aa  125  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  32.3 
 
 
293 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  35.85 
 
 
283 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.03 
 
 
298 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  33.17 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  33.73 
 
 
295 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  33.99 
 
 
330 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  29.13 
 
 
268 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  28.76 
 
 
275 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  33.51 
 
 
268 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  33.71 
 
 
268 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  33.71 
 
 
268 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  33 
 
 
252 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  31.94 
 
 
232 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  34.83 
 
 
737 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  35.8 
 
 
492 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  35 
 
 
454 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  37.5 
 
 
726 aa  96.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
496 aa  96.7  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  34.58 
 
 
751 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  30.47 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  32.35 
 
 
505 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  35 
 
 
766 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  31.31 
 
 
443 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.09 
 
 
240 aa  93.2  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  31.31 
 
 
497 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 
217 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
474 aa  92.4  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  35.85 
 
 
257 aa  92.4  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  33.51 
 
 
233 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.52 
 
 
730 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  31.4 
 
 
508 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  30.13 
 
 
233 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  34.59 
 
 
233 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  34.73 
 
 
721 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  29.96 
 
 
464 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  31.84 
 
 
734 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  33.18 
 
 
747 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  34.05 
 
 
233 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  31.19 
 
 
790 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  32.51 
 
 
615 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  34.05 
 
 
233 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  34.18 
 
 
667 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 
731 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.95 
 
 
804 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.79 
 
 
726 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.63 
 
 
235 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  28.82 
 
 
217 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.77 
 
 
220 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  35.86 
 
 
790 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  30.65 
 
 
225 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.51 
 
 
234 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  29.11 
 
 
257 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  31.19 
 
 
477 aa  86.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  32.52 
 
 
803 aa  87  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.65 
 
 
575 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  32.46 
 
 
764 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  33.53 
 
 
741 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  30.05 
 
 
225 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  28.37 
 
 
780 aa  85.9  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  30.48 
 
 
466 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  35.47 
 
 
525 aa  85.9  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.92 
 
 
463 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  30.05 
 
 
225 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  37.72 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 
503 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0748  XRE family transcriptional regulator  37.3 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  33.16 
 
 
734 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.5 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  31.62 
 
 
472 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  38.67 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30.2 
 
 
739 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  31.38 
 
 
778 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30.2 
 
 
739 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  30.2 
 
 
739 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  35.76 
 
 
529 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>