More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2363 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 
275 aa  558  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  58.91 
 
 
282 aa  322  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  54.79 
 
 
294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  54.45 
 
 
294 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  52.63 
 
 
283 aa  285  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  53.7 
 
 
266 aa  275  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  56.03 
 
 
281 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  50.18 
 
 
295 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  44.13 
 
 
293 aa  242  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  49.1 
 
 
298 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  43.48 
 
 
330 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  42.41 
 
 
392 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  44.19 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  38.36 
 
 
299 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  33.85 
 
 
306 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  32.52 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  35.37 
 
 
299 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  38.32 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  35.22 
 
 
323 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  30.72 
 
 
305 aa  128  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  36.02 
 
 
314 aa  128  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  38 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  38.12 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  35.66 
 
 
453 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  38.76 
 
 
492 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.98 
 
 
217 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  37.78 
 
 
503 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  37.33 
 
 
472 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.03 
 
 
496 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  34.98 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  35 
 
 
217 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  33.79 
 
 
224 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.45 
 
 
240 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  37.37 
 
 
484 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  34.43 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  35.57 
 
 
508 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.79 
 
 
215 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  38.65 
 
 
211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.44 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  36.45 
 
 
244 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  35.23 
 
 
497 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  35.75 
 
 
443 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  32.34 
 
 
667 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  33.63 
 
 
730 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  34.12 
 
 
246 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  37.44 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  34.63 
 
 
474 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.58 
 
 
250 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  30.45 
 
 
297 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.43 
 
 
235 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  34.01 
 
 
466 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  31.13 
 
 
509 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  32.44 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  36 
 
 
525 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  33.33 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  36.6 
 
 
490 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  30.57 
 
 
615 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  34.39 
 
 
722 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.44 
 
 
464 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  32.99 
 
 
505 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  33.97 
 
 
257 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  36.16 
 
 
734 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  36.32 
 
 
492 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.51 
 
 
463 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  28.76 
 
 
318 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  34.18 
 
 
477 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.88 
 
 
454 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  31.6 
 
 
306 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  35.38 
 
 
252 aa  106  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  34.76 
 
 
335 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  30.45 
 
 
373 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  30.67 
 
 
330 aa  105  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  34.71 
 
 
733 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.13 
 
 
575 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  33.51 
 
 
790 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  31.36 
 
 
233 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  32.77 
 
 
268 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  35.29 
 
 
804 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  32.77 
 
 
268 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0748  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
242 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  31.36 
 
 
233 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  30.91 
 
 
233 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  31.36 
 
 
233 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  32.77 
 
 
268 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  33.79 
 
 
239 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  31.36 
 
 
233 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  35.88 
 
 
795 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.36 
 
 
234 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2447  capsular exopolysaccharide family  35.64 
 
 
278 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13568  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  30.62 
 
 
721 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  31.9 
 
 
745 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  30.67 
 
 
800 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  35 
 
 
750 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  33.9 
 
 
268 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.92 
 
 
230 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.92 
 
 
230 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  33.5 
 
 
727 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.75 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  30.41 
 
 
524 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.99 
 
 
228 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>