More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1926 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  100 
 
 		 330 aa  654    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  64.02 
 
 		 306 aa  292  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  54.58 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  42.37 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  42.53 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  39.49 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  44.55 
 
 		 332 aa  185  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  42.75 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  35.91 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  40.34 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  41.85 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  34.07 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  39.21 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  38.05 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  38.43 
 
 		 297 aa  159  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.45 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  41.35 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  35.94 
 
 		 257 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  36.16 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  34.82 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.86 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.25 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  36.79 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  28.68 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  33.19 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  31.43 
 
 		 275 aa  99  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  35.75 
 
 		 737 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  32.79 
 
 		 233 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.21 
 
 		 281 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  30.74 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2965  chromosome partitioning ATPase  29.91 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  32.91 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  31.58 
 
 		 233 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  32.26 
 
 		 233 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  32.49 
 
 		 233 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.16 
 
 		 298 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  32.47 
 
 		 232 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.08 
 
 		 234 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  26.34 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  34.21 
 
 		 211 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  35.59 
 
 		 780 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  38.89 
 
 		 744 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.11 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  33.64 
 
 		 731 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  35.35 
 
 		 739 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  35.35 
 
 		 739 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  35.35 
 
 		 739 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 250 aa  86.7  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  37.5 
 
 		 744 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  34.88 
 
 		 739 aa  85.9  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  31.18 
 
 		 721 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  32.29 
 
 		 778 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.43 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  26.52 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  30.77 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  33.52 
 
 		 784 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  26.14 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  31.4 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  35.03 
 
 		 741 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  34.46 
 
 		 741 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  36.81 
 
 		 741 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  29.26 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.03 
 
 		 741 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  26.14 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  30.59 
 
 		 726 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  30.5 
 
 		 225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  27.57 
 
 		 772 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  30.61 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  30.21 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  29.74 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  32.45 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  27.25 
 
 		 740 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  33.16 
 
 		 746 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  32.28 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  33.51 
 
 		 747 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  32.14 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  30.61 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  32.52 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  32.52 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  35.2 
 
 		 755 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  28.49 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  34.97 
 
 		 726 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  34.67 
 
 		 741 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  33.7 
 
 		 747 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 624 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 741 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 		 741 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  33.33 
 
 		 741 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  33.52 
 
 		 784 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  32.87 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 		 790 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.51 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  29.15 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.62 
 
 		 800 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.63 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  32.11 
 
 		 756 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  31.41 
 
 		 492 aa  75.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  35.93 
 
 		 503 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>