More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3069 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  85.48 
 
 		 293 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  61.5 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  51.78 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  49.28 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  50 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  48.11 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  47.32 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  48.22 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  47.21 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  34.07 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  34.76 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  32.56 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  35.15 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  36.28 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  36.71 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  34.78 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.92 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  31.5 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.92 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  36.32 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.81 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  36.44 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  31.91 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  38.92 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  33.99 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  35.82 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  40.61 
 
 		 492 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.79 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  36.23 
 
 		 730 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  33.02 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  35.44 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.36 
 
 		 453 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  31.03 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  36.22 
 
 		 474 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  33.33 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.86 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  31.43 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  33.33 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  31.61 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  32.85 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  32.81 
 
 		 205 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  28.52 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.09 
 
 		 217 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  34.48 
 
 		 751 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  32.34 
 
 		 738 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  32.85 
 
 		 233 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  32.81 
 
 		 790 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  32.04 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.75 
 
 		 800 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  32.08 
 
 		 734 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.37 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  33.49 
 
 		 443 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 		 497 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.96 
 
 		 220 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  31.96 
 
 		 529 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  40.24 
 
 		 778 aa  99.8  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  29.38 
 
 		 221 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  32.62 
 
 		 244 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  36.84 
 
 		 780 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.65 
 
 		 235 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  33.18 
 
 		 667 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.36 
 
 		 492 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.14 
 
 		 780 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  30.37 
 
 		 795 aa  97.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  30.28 
 
 		 524 aa  97.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  36.87 
 
 		 755 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  38.86 
 
 		 772 aa  95.9  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.1 
 
 		 726 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  34.1 
 
 		 726 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.1 
 
 		 726 aa  95.9  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.1 
 
 		 726 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.1 
 
 		 726 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  32.68 
 
 		 508 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  34.1 
 
 		 726 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.1 
 
 		 726 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.1 
 
 		 726 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  31.91 
 
 		 803 aa  95.5  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.88 
 
 		 737 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  32.83 
 
 		 615 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  35.45 
 
 		 745 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  32.89 
 
 		 722 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  31.47 
 
 		 790 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.45 
 
 		 741 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  32.62 
 
 		 803 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  32.41 
 
 		 211 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  29.17 
 
 		 784 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  35.45 
 
 		 741 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  30.58 
 
 		 252 aa  94.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  35.45 
 
 		 741 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  31.43 
 
 		 753 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  30.16 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.81 
 
 		 225 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  31.7 
 
 		 781 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  31.78 
 
 		 521 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  31.28 
 
 		 225 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  33.17 
 
 		 505 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  32.64 
 
 		 472 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>