More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2579 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 
330 aa  675    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  71.55 
 
 
392 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  41 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  43.48 
 
 
275 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  40.19 
 
 
283 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  42.41 
 
 
281 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  37.88 
 
 
294 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  37.12 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  34.36 
 
 
293 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  38.65 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  37.69 
 
 
306 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.07 
 
 
298 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  39.32 
 
 
266 aa  142  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  40.53 
 
 
257 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.72 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  32.03 
 
 
268 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  30.68 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  32.75 
 
 
268 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  32.31 
 
 
268 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  37.31 
 
 
299 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  35.87 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  33.47 
 
 
323 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  35.15 
 
 
297 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  35.33 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  40.8 
 
 
265 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  30.29 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  33.99 
 
 
318 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  34.95 
 
 
233 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.46 
 
 
250 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  30.3 
 
 
332 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  36.22 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  33.98 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  30.83 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  34.63 
 
 
221 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  39.29 
 
 
605 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  36.87 
 
 
288 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  34.47 
 
 
233 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  39.7 
 
 
624 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  33.98 
 
 
233 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  33.98 
 
 
233 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  32.06 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  38.32 
 
 
735 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.12 
 
 
234 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  34.5 
 
 
484 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32 
 
 
235 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  34.86 
 
 
297 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  31.88 
 
 
217 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  35.68 
 
 
503 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.36 
 
 
240 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  32.46 
 
 
259 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  39.59 
 
 
211 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.4 
 
 
217 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  28.68 
 
 
330 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  36.11 
 
 
790 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.18 
 
 
306 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.38 
 
 
739 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  38.04 
 
 
453 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  31.02 
 
 
509 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.16 
 
 
454 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  35.02 
 
 
490 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  31.02 
 
 
733 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.73 
 
 
464 aa  99.4  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  34.3 
 
 
492 aa  99  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  34.29 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  34.33 
 
 
225 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  37.11 
 
 
753 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  37.36 
 
 
463 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  32.84 
 
 
754 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  30.58 
 
 
496 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  34.29 
 
 
800 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  34.12 
 
 
815 aa  97.4  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  35.08 
 
 
508 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  36.18 
 
 
224 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  33.16 
 
 
205 aa  96.3  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  32.67 
 
 
521 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  35.24 
 
 
244 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  31.68 
 
 
730 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  31.28 
 
 
745 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  37.31 
 
 
233 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.84 
 
 
737 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  32.84 
 
 
225 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.17 
 
 
575 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  33.83 
 
 
225 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  33.33 
 
 
257 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  31.44 
 
 
763 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  33.66 
 
 
252 aa  93.6  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  31 
 
 
804 aa  93.2  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  36.47 
 
 
746 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  25.85 
 
 
255 aa  92.8  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  33.16 
 
 
529 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  33.67 
 
 
756 aa  92.4  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 
730 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  31.69 
 
 
741 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  31.09 
 
 
806 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3389  chromosome partitioning ATPase  27.31 
 
 
276 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  34.17 
 
 
615 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  31.47 
 
 
721 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  30.81 
 
 
784 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  30.95 
 
 
373 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>