More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0832 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  100 
 
 
295 aa  591  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  57.81 
 
 
293 aa  308  8e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  58.09 
 
 
298 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  48.94 
 
 
282 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  49.82 
 
 
275 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  48.54 
 
 
266 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  47.62 
 
 
294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  47.6 
 
 
294 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  47.79 
 
 
283 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  49.78 
 
 
281 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  36.96 
 
 
392 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  31.96 
 
 
299 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  36.11 
 
 
314 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  38.79 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  35.84 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  37.62 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  32.07 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  30.99 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.88 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  38.61 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  32.34 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  35.79 
 
 
297 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  41.3 
 
 
503 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  36.6 
 
 
295 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  38.17 
 
 
453 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.5 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.93 
 
 
217 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  34.56 
 
 
217 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  34.26 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  34.6 
 
 
297 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.38 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  35.68 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  37.38 
 
 
790 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  37.19 
 
 
667 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  37.56 
 
 
332 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  34.51 
 
 
233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  35.14 
 
 
730 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  34.51 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  35.74 
 
 
615 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  34.51 
 
 
233 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  34.14 
 
 
306 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  36.24 
 
 
795 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  39.06 
 
 
474 aa  112  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  37.98 
 
 
211 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  33.18 
 
 
225 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  33.63 
 
 
233 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  37.44 
 
 
265 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  33.19 
 
 
233 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  35.24 
 
 
252 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.78 
 
 
235 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  37.29 
 
 
803 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  32.27 
 
 
225 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  34.84 
 
 
529 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.63 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  32.94 
 
 
755 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  32.73 
 
 
225 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  37.22 
 
 
454 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  31.82 
 
 
257 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  33.98 
 
 
246 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  36.62 
 
 
496 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.2 
 
 
220 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  35.59 
 
 
232 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  34.17 
 
 
745 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.27 
 
 
225 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  37.26 
 
 
722 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  38.14 
 
 
490 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  32.23 
 
 
335 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.64 
 
 
524 aa  106  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  35.32 
 
 
257 aa  105  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  32.89 
 
 
373 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  34.19 
 
 
472 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  33.94 
 
 
521 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  35.75 
 
 
803 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  34.01 
 
 
443 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  34.01 
 
 
497 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  31.36 
 
 
225 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  33.67 
 
 
804 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  35.04 
 
 
741 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  37.07 
 
 
484 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 
508 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  35.05 
 
 
477 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  34.02 
 
 
720 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  34.02 
 
 
720 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  37.42 
 
 
492 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.56 
 
 
737 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  34.02 
 
 
720 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.52 
 
 
230 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.96 
 
 
463 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  34.54 
 
 
720 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.52 
 
 
230 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  34.02 
 
 
720 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  34.02 
 
 
720 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.19 
 
 
575 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  34.02 
 
 
205 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  33.96 
 
 
224 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  34.98 
 
 
726 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  33.96 
 
 
233 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.1 
 
 
760 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  32.73 
 
 
743 aa  99  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  35.41 
 
 
731 aa  99  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>