More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2473 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  100 
 
 
282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  60.38 
 
 
275 aa  316  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  55.17 
 
 
294 aa  310  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  55.17 
 
 
294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  52.96 
 
 
283 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  49.63 
 
 
266 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  54.05 
 
 
281 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  49.82 
 
 
295 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  45.32 
 
 
293 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  49.28 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  35.57 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  38.65 
 
 
330 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  37.39 
 
 
392 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  39.25 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  40.98 
 
 
297 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  40.4 
 
 
284 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  36.77 
 
 
299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  40.49 
 
 
496 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  39.61 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  39.5 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  36.44 
 
 
466 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  39.79 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  38.31 
 
 
323 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  39.52 
 
 
453 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  37.07 
 
 
232 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  36.76 
 
 
508 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  34.4 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  33.94 
 
 
233 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.4 
 
 
234 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  33.49 
 
 
233 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.19 
 
 
240 aa  125  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  37.24 
 
 
443 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  37.24 
 
 
497 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  33.49 
 
 
233 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  34.78 
 
 
509 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  33.03 
 
 
233 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  37.07 
 
 
472 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  38.83 
 
 
332 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35 
 
 
217 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  38.6 
 
 
295 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  34.47 
 
 
505 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  36.6 
 
 
297 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  41.24 
 
 
490 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  36.19 
 
 
299 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  35.41 
 
 
318 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  34.55 
 
 
217 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  36.99 
 
 
239 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  38.76 
 
 
257 aa  122  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.77 
 
 
730 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.12 
 
 
575 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  37.56 
 
 
246 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  36.82 
 
 
722 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  37.12 
 
 
454 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  39.46 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  36.1 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  38.57 
 
 
525 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  32.55 
 
 
615 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  36.06 
 
 
790 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  36.92 
 
 
503 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  37.14 
 
 
211 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  34.06 
 
 
734 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  35.24 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  34.22 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  32.9 
 
 
667 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.69 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  32.87 
 
 
373 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  38.3 
 
 
463 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  39.59 
 
 
484 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.82 
 
 
235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  36.1 
 
 
474 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  35.56 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  38.27 
 
 
492 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  33.49 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  36.14 
 
 
742 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  31.25 
 
 
330 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.24 
 
 
780 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  37.09 
 
 
605 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.26 
 
 
524 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.51 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  33.64 
 
 
225 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  34.25 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.98 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  34.1 
 
 
225 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2447  capsular exopolysaccharide family  36.92 
 
 
278 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13568  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  32.74 
 
 
780 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.88 
 
 
215 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  37.09 
 
 
624 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  35.35 
 
 
784 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  33.64 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.1 
 
 
225 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  33.93 
 
 
464 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.62 
 
 
804 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  31.84 
 
 
781 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12770  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  35.67 
 
 
279 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.17 
 
 
220 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.82 
 
 
800 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  32.72 
 
 
225 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  37.36 
 
 
217 aa  106  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  32.69 
 
 
721 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  37.19 
 
 
492 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>