More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3119 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  100 
 
 		 335 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  43.42 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  44.57 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  40.28 
 
 		 318 aa  189  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  39.84 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  41.1 
 
 		 306 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.3 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  43.33 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  41.63 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  38.93 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  39.03 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  37.72 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  42.54 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  38.66 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  44.02 
 
 		 265 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  37.5 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.29 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.61 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  34.75 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  40.1 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.6 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  34.17 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  35.23 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  34.16 
 
 		 294 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.42 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  30.86 
 
 		 266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.78 
 
 		 281 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  34.76 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  31.82 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  30.7 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  28.45 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  32.37 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 250 aa  93.2  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  28.36 
 
 		 252 aa  92.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2965  chromosome partitioning ATPase  30.77 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  32.58 
 
 		 721 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0748  XRE family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  27.36 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  30.36 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  34.85 
 
 		 746 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  30.36 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  32.49 
 
 		 719 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  32.49 
 
 		 719 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  32.49 
 
 		 719 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  28.8 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  35.35 
 
 		 747 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  32.49 
 
 		 719 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  34.34 
 
 		 745 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  33.83 
 
 		 780 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  30.46 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  28.21 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  31.98 
 
 		 719 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  29.57 
 
 		 615 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  34.32 
 
 		 525 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  27.35 
 
 		 225 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  32.65 
 
 		 753 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  29.61 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  27.35 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1658  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.15 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  32.65 
 
 		 735 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  33.49 
 
 		 764 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  30.54 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  35.71 
 
 		 780 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  30.05 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  28.71 
 
 		 795 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  30.5 
 
 		 750 aa  76.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  30.65 
 
 		 746 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  34.74 
 
 		 790 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  33.33 
 
 		 744 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.18 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  31.09 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.71 
 
 		 741 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  29.06 
 
 		 667 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.5 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  30.46 
 
 		 720 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  36.71 
 
 		 741 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  33.52 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  31.61 
 
 		 720 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  31.09 
 
 		 720 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  31.09 
 
 		 720 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  31.09 
 
 		 720 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  31.09 
 
 		 720 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  34.55 
 
 		 744 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  31.09 
 
 		 720 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  29.53 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.25 
 
 		 800 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  33.93 
 
 		 684 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  32.89 
 
 		 803 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30.43 
 
 		 739 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30.8 
 
 		 739 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  36.08 
 
 		 741 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  29 
 
 		 755 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  32.48 
 
 		 741 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  30.43 
 
 		 739 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  34.05 
 
 		 716 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  28.96 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  33.17 
 
 		 751 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.69 
 
 		 737 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  30.73 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  32.34 
 
 		 734 aa  72.8  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>