More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1016 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  39.56 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  39.56 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  39.33 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  38.67 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  32.32 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2410  exopolysaccharide biosynthesis domain-containing protein  33.49 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  29.18 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4240  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.44 
 
 		 285 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.335949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  32.5 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3389  chromosome partitioning ATPase  27.14 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.3 
 
 		 464 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  28.7 
 
 		 392 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.37 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  28.19 
 
 		 295 aa  99  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.53 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.22 
 
 		 305 aa  95.9  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  32.46 
 
 		 751 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  29.95 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  28.75 
 
 		 496 aa  92.8  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  28.86 
 
 		 323 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  29.09 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.51 
 
 		 299 aa  88.6  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  26.44 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  33.18 
 
 		 509 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  31.84 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  31.17 
 
 		 747 aa  85.5  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  35.05 
 
 		 472 aa  85.5  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.82 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.05 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  31.3 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  27.23 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  29.71 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  25.68 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.47 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  32.24 
 
 		 332 aa  82  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  28.19 
 
 		 667 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  26.07 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  27.56 
 
 		 615 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.62 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  29.15 
 
 		 605 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  25.97 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0845  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.49 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 		 737 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  29.6 
 
 		 764 aa  78.6  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  29.23 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  32.14 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  34.39 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.47 
 
 		 720 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  27.84 
 
 		 755 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  30.59 
 
 		 755 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  27.19 
 
 		 772 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  28.57 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  28.11 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  29.58 
 
 		 624 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.32 
 
 		 741 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  30.51 
 
 		 790 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  28.23 
 
 		 778 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  27.27 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  25.45 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  29.67 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  26.96 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.85 
 
 		 750 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  28.51 
 
 		 739 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 730 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  29.31 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  28.51 
 
 		 739 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  30.69 
 
 		 780 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  28.51 
 
 		 739 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  25.94 
 
 		 766 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  29.46 
 
 		 750 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  28.05 
 
 		 739 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  27.63 
 
 		 747 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.05 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  29.17 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.72 
 
 		 751 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  29.52 
 
 		 753 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.96 
 
 		 741 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  29.41 
 
 		 741 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  28.96 
 
 		 741 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  25.98 
 
 		 720 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  25.98 
 
 		 720 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  27.93 
 
 		 490 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  25.98 
 
 		 720 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  25.98 
 
 		 720 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  25.98 
 
 		 720 aa  68.9  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  25.98 
 
 		 720 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  25.98 
 
 		 720 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2732  tyrosine kinase  27.69 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677811 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.33 
 
 		 741 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  29.33 
 
 		 741 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  25.98 
 
 		 720 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  29.33 
 
 		 741 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  32.87 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.23 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>