More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3389 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3389  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 		 276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4240  chromosome partitioning ATPase protein-like  40.35 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.335949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  34.33 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2410  exopolysaccharide biosynthesis domain-containing protein  31.25 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  31.1 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  29.81 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  28.85 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  28.85 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  27.14 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  26.92 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  27.27 
 
 		 330 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  27.67 
 
 		 755 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0845  chromosome partitioning ATPase protein-like  28.3 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  26.03 
 
 		 239 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  24.79 
 
 		 496 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  24.48 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  28.12 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  27.8 
 
 		 764 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  27.04 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  26.61 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  27.75 
 
 		 751 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  28.44 
 
 		 743 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  23.32 
 
 		 392 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  27.91 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  27.91 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.59 
 
 		 575 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  28 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  30.21 
 
 		 708 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  26.11 
 
 		 745 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  24.92 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  26.37 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  25.91 
 
 		 778 aa  72.4  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  23.5 
 
 		 232 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  25.24 
 
 		 755 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  26.86 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  27.27 
 
 		 734 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.32 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  28.17 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  24.4 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  26.83 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.4 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  24.22 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  26.34 
 
 		 727 aa  68.9  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  28.57 
 
 		 730 aa  68.9  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.55 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  26.52 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.28 
 
 		 736 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  24.35 
 
 		 772 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.88 
 
 		 770 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  27.36 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  25.11 
 
 		 667 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  29.06 
 
 		 756 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  24.09 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  26.29 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.38 
 
 		 721 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.84 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  23.26 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  27.4 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 737 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  23.26 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  24.32 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  28.74 
 
 		 802 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  26.57 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.35 
 
 		 806 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  22.07 
 
 		 750 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  25.24 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 730 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  25.98 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  24.62 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  25.62 
 
 		 721 aa  65.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.41 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.15 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  23.5 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.72 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.15 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  27.57 
 
 		 737 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.79 
 
 		 756 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  22.47 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  27.27 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  25.47 
 
 		 766 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.23 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  22.87 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  27.78 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.6 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  24.12 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  26.32 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  25.39 
 
 		 726 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  27.27 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.23 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  26.79 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  27.23 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.62 
 
 		 790 aa  62.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  23.79 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  26.17 
 
 		 527 aa  62.4  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.27 
 
 		 726 aa  62.4  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  30.33 
 
 		 624 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  29.86 
 
 		 605 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>