138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0845 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0845  chromosome partitioning ATPase protein-like  100 
 
 		 245 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  33 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2410  exopolysaccharide biosynthesis domain-containing protein  34.84 
 
 		 333 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3389  chromosome partitioning ATPase  28.3 
 
 		 276 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  30.04 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  29.39 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  32.64 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  31.96 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  30.21 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4240  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.5 
 
 		 285 aa  85.9  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.335949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  29.25 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  26.36 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  28.43 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  26.11 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.56 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  27.46 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  25.13 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  30.65 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  27.69 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  27.44 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  31.22 
 
 		 750 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  24.6 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.88 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.92 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  30.51 
 
 		 755 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.05 
 
 		 335 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  33.53 
 
 		 744 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  29.48 
 
 		 737 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.71 
 
 		 453 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  27.01 
 
 		 731 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 		 438 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 		 373 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  30.65 
 
 		 323 aa  52.4  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  28.57 
 
 		 332 aa  52.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.21 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  27.5 
 
 		 525 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  24.74 
 
 		 293 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  29.7 
 
 		 795 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  32.6 
 
 		 615 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  33.1 
 
 		 503 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2503  chromosome partitioning ATPase-like protein  32.3 
 
 		 644 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.527342  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  34.59 
 
 		 490 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  31.54 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  30.16 
 
 		 412 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.87 
 
 		 454 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2365  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.31 
 
 		 306 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 		 297 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 323 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  30.59 
 
 		 508 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  25.12 
 
 		 794 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0736  tyrosine kinase  30.29 
 
 		 315 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.49 
 
 		 726 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.22 
 
 		 739 aa  48.5  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  26.29 
 
 		 474 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.62 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  25.34 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.69 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  34.21 
 
 		 734 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.35 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  25.1 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  29.07 
 
 		 314 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  28.21 
 
 		 509 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  27.41 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  27.12 
 
 		 713 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2732  tyrosine kinase  25.89 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  29.17 
 
 		 775 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.34 
 
 		 575 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.24 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  30 
 
 		 764 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 524 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  28.77 
 
 		 505 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  22.34 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  25 
 
 		 739 aa  46.6  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  32 
 
 		 469 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  31.72 
 
 		 484 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0330  chromosome partitioning ATPase protein-like  30.81 
 
 		 539 aa  46.2  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  23 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  28.22 
 
 		 330 aa  45.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  22.34 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28.14 
 
 		 790 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0204  chromosome partitioning ATPase  31.4 
 
 		 315 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  25.25 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  30.56 
 
 		 726 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  26.67 
 
 		 464 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1397  flagellar synthesis regulator FleN, putative  28.1 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  26.47 
 
 		 755 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 412 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  27.98 
 
 		 772 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 389 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  28.57 
 
 		 472 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  32.28 
 
 		 387 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  27.85 
 
 		 784 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  29.75 
 
 		 746 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  27.14 
 
 		 585 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  29.71 
 
 		 473 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 737 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  26.32 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 738 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>