More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0204 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0204  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
315 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  35.75 
 
 
615 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  36.71 
 
 
469 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  38.1 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 
505 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  28.99 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  33.83 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
454 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  30.37 
 
 
667 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0736  tyrosine kinase  30 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  30.77 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  34.38 
 
 
508 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  32.85 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  32.85 
 
 
497 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.44 
 
 
720 aa  76.6  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  33.84 
 
 
472 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.51 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.51 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  27.35 
 
 
753 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  32.52 
 
 
711 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  30.84 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  31.11 
 
 
684 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  27.86 
 
 
727 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  34.29 
 
 
756 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.55 
 
 
804 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  29.38 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.04 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.88 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  27.35 
 
 
753 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  31.43 
 
 
743 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  29.36 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  27.85 
 
 
474 aa  72.8  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.3 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  30.05 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  33.14 
 
 
745 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.78 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 
730 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2732  tyrosine kinase  26.94 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0677811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  28.84 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  28.84 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  31.43 
 
 
772 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.55 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.81 
 
 
780 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  27.57 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2365  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.89 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  29.41 
 
 
722 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.18 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  28.49 
 
 
741 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  29.81 
 
 
781 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  27.05 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  28.78 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  30.05 
 
 
790 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  32.84 
 
 
490 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.49 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  29.03 
 
 
246 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  29.38 
 
 
803 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  26.92 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  29.5 
 
 
521 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  26.03 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  31.28 
 
 
778 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.7 
 
 
575 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  31.43 
 
 
784 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  25.51 
 
 
751 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  32.65 
 
 
763 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  29.6 
 
 
731 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  28.29 
 
 
741 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2830  capsular exopolysaccharide family  36.32 
 
 
250 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.262638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  29.17 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  27.42 
 
 
779 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 
740 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2514  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 
735 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  30.22 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2735  capsular exopolysaccharide family  36.32 
 
 
250 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0915032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  30.81 
 
 
736 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  29.44 
 
 
753 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.73 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  30.48 
 
 
224 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3592  chromosome partitioning ATPase  28.49 
 
 
735 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.857292  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  24.69 
 
 
724 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  28.5 
 
 
529 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.96 
 
 
721 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  29.15 
 
 
624 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  30.23 
 
 
605 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  26.77 
 
 
330 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  30.59 
 
 
800 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  43.68 
 
 
525 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  26.34 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2022  chromosome partitioning ATPase  26.59 
 
 
215 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  24.37 
 
 
392 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.61 
 
 
800 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  29.59 
 
 
780 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1420  capsular exopolysaccharide family  30.22 
 
 
229 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0943338  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  31.71 
 
 
503 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.5 
 
 
524 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.49 
 
 
492 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  28.72 
 
 
794 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  30.99 
 
 
742 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.88 
 
 
220 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>