More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0251 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  56.26 
 
 
753 aa  858    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  58.1 
 
 
753 aa  872    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 
751 aa  1525    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  31.48 
 
 
734 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  33.8 
 
 
721 aa  382  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  30.85 
 
 
719 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  30.89 
 
 
719 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  31.02 
 
 
719 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  30.89 
 
 
719 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  30.93 
 
 
719 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  31.23 
 
 
720 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  31.23 
 
 
720 aa  369  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  31.37 
 
 
720 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  31.5 
 
 
720 aa  369  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  31.23 
 
 
720 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  31.37 
 
 
720 aa  369  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  31.23 
 
 
720 aa  365  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  31.23 
 
 
720 aa  365  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  29.95 
 
 
720 aa  362  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  31.72 
 
 
751 aa  360  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  32.5 
 
 
716 aa  360  7e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  31.17 
 
 
747 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  30.3 
 
 
726 aa  356  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  30.55 
 
 
744 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  30.93 
 
 
730 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  32.34 
 
 
746 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  30.34 
 
 
736 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  30.74 
 
 
744 aa  354  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  31.72 
 
 
724 aa  352  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  31.53 
 
 
746 aa  351  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  29.66 
 
 
722 aa  350  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  31.39 
 
 
746 aa  349  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  32.04 
 
 
745 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  29.17 
 
 
746 aa  348  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  31.26 
 
 
746 aa  347  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  30.61 
 
 
736 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  29.74 
 
 
741 aa  347  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  30.91 
 
 
723 aa  347  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  31.63 
 
 
745 aa  346  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  29.75 
 
 
748 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  32.46 
 
 
734 aa  344  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  30.63 
 
 
749 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  31.04 
 
 
759 aa  343  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  30.88 
 
 
747 aa  341  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  31.12 
 
 
733 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  30.76 
 
 
747 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  31.49 
 
 
746 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  30.31 
 
 
723 aa  339  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  30.56 
 
 
726 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  29.89 
 
 
727 aa  338  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.56 
 
 
726 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.56 
 
 
726 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.15 
 
 
726 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.15 
 
 
726 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.15 
 
 
726 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  30.15 
 
 
726 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.15 
 
 
726 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  31.22 
 
 
745 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  29.18 
 
 
731 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  30.9 
 
 
745 aa  333  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  31 
 
 
735 aa  330  8e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  29.32 
 
 
740 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  31.14 
 
 
755 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.24 
 
 
760 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  29.57 
 
 
739 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  30.54 
 
 
760 aa  327  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  30.24 
 
 
739 aa  327  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  29.85 
 
 
724 aa  326  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  29.48 
 
 
745 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  31.2 
 
 
753 aa  325  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  29.88 
 
 
739 aa  324  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.8 
 
 
736 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  29.97 
 
 
739 aa  323  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  31.16 
 
 
747 aa  320  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  29.2 
 
 
746 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  30.33 
 
 
740 aa  318  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  29.31 
 
 
750 aa  313  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.54 
 
 
730 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  27.95 
 
 
757 aa  313  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.72 
 
 
726 aa  310  9e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  30.96 
 
 
721 aa  309  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  27.15 
 
 
764 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.98 
 
 
741 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.61 
 
 
741 aa  303  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.85 
 
 
741 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  28.85 
 
 
741 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  28.85 
 
 
741 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  28.25 
 
 
741 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.25 
 
 
741 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  29.08 
 
 
755 aa  299  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.57 
 
 
726 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  28.23 
 
 
740 aa  297  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  28.55 
 
 
754 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  27.3 
 
 
744 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  26.07 
 
 
747 aa  291  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  27.34 
 
 
740 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.55 
 
 
730 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  27.89 
 
 
764 aa  282  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  28.19 
 
 
740 aa  281  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  26.38 
 
 
802 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>