More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4787 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 		 255 aa  530  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4240  chromosome partitioning ATPase protein-like  36.32 
 
 		 285 aa  174  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.335949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2410  exopolysaccharide biosynthesis domain-containing protein  41.43 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3389  chromosome partitioning ATPase  34.33 
 
 		 276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  32.14 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  31.7 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  32.14 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  32.14 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  32.14 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  30.22 
 
 		 392 aa  101  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  32.86 
 
 		 261 aa  101  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0845  chromosome partitioning ATPase protein-like  33 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  30.43 
 
 		 509 aa  99.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  25.85 
 
 		 330 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.94 
 
 		 454 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  27.56 
 
 		 747 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.44 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  34.63 
 
 		 525 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  31.42 
 
 		 503 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  31.34 
 
 		 490 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  26.79 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  31.4 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  28.37 
 
 		 615 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  28.9 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  34.81 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  30.77 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  33.5 
 
 		 484 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.58 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  30.98 
 
 		 305 aa  82  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.64 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  27.86 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  26.86 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  30.46 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  28.27 
 
 		 730 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  32.37 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.3 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  27.86 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  29.1 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  27.86 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  27.36 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  28.5 
 
 		 759 aa  79.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  35.14 
 
 		 473 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  28.49 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  31.9 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.44 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.79 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  32.99 
 
 		 756 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  29.05 
 
 		 764 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.65 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  30.65 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  32.37 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  29.86 
 
 		 751 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.65 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.84 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.65 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.65 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.65 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  30.65 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.65 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.73 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  28.99 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  30.86 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  28.65 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  27.19 
 
 		 755 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  28.99 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  27.98 
 
 		 721 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  29.8 
 
 		 743 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  27.49 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  28.36 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.34 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.61 
 
 		 721 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  31.43 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  27.59 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  24.87 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  29.3 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.06 
 
 		 739 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  31 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  29.29 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.3 
 
 		 741 aa  72  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.14 
 
 		 726 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  28.35 
 
 		 472 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  25.96 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  30.05 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  28.11 
 
 		 794 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  29.32 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  27.89 
 
 		 753 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  27.45 
 
 		 733 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  26.94 
 
 		 754 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.42 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  30.12 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  29.06 
 
 		 722 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  25.13 
 
 		 726 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  26.21 
 
 		 755 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  25.64 
 
 		 747 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  26.51 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  28.57 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  26.7 
 
 		 747 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  31.41 
 
 		 775 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>