272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2410 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2410  exopolysaccharide biosynthesis domain-containing protein  100 
 
 		 333 aa  669    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  41.43 
 
 		 255 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4240  chromosome partitioning ATPase protein-like  33.81 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.335949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3389  chromosome partitioning ATPase  31.25 
 
 		 276 aa  139  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  34.62 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  33.5 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  31.73 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  31.73 
 
 		 268 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  31.73 
 
 		 268 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  29.41 
 
 		 261 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0845  chromosome partitioning ATPase protein-like  34.84 
 
 		 245 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  29.81 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  32.82 
 
 		 295 aa  89.4  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  28.24 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  30.2 
 
 		 751 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  32.52 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.8 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  32.89 
 
 		 778 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  31.3 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.75 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  31.55 
 
 		 605 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.72 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  29.15 
 
 		 509 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.86 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  32.37 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  31.88 
 
 		 233 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  31.73 
 
 		 246 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.03 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  29.95 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  28 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0394  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  33.64 
 
 		 787 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.5 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  31.75 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  30.39 
 
 		 776 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  29.21 
 
 		 496 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  29.47 
 
 		 746 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  29.47 
 
 		 746 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  29.47 
 
 		 746 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  24.88 
 
 		 249 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  30.05 
 
 		 755 aa  66.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.36 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  31.05 
 
 		 737 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  27.88 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  28.27 
 
 		 730 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  25.74 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  28.44 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  28.08 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  28.77 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  32.34 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  30 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  31.22 
 
 		 747 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  32.14 
 
 		 746 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  28.03 
 
 		 790 aa  62.8  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  32.65 
 
 		 747 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  32.04 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  29.92 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  28.99 
 
 		 746 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  25.98 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  26.73 
 
 		 745 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0085  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.63 
 
 		 787 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1087  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  31.63 
 
 		 787 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.5 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1525  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.63 
 
 		 787 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  30.89 
 
 		 749 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2689  chain length determinant family protein  31.63 
 
 		 787 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1245  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.63 
 
 		 787 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.86 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0101  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.63 
 
 		 760 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  28.99 
 
 		 746 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  29.21 
 
 		 711 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  23.3 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.16 
 
 		 751 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  27.62 
 
 		 795 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  27.23 
 
 		 745 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  29.17 
 
 		 740 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  27.75 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  31.75 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  31.6 
 
 		 472 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  27.7 
 
 		 747 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2840  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.12 
 
 		 787 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.540822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  25.36 
 
 		 764 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  24.74 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  22.43 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  26.24 
 
 		 745 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  29.63 
 
 		 740 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  29.9 
 
 		 745 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  28.82 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.63 
 
 		 804 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  31.07 
 
 		 783 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  24.44 
 
 		 772 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  29.29 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  27.75 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  30.43 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.23 
 
 		 720 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.85 
 
 		 739 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  30.09 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  29.23 
 
 		 739 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>