More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2365 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2365  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2732  tyrosine kinase  63.25 
 
 		 303 aa  367  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0736  tyrosine kinase  58.28 
 
 		 315 aa  358  7e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1377  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.16 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1879  protein-tyrosine kinase  40.94 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0244  protein-tyrosine kinase  39.78 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2024  protein-tyrosine kinase  41.91 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.607078  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0150  hypothetical protein  34.8 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1793  hypothetical protein  35.34 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.677381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.63 
 
 		 225 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  35.61 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  37.96 
 
 		 790 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  33.98 
 
 		 225 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  34.38 
 
 		 492 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  33.01 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  33.01 
 
 		 225 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.37 
 
 		 217 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.21 
 
 		 464 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  32.2 
 
 		 225 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  35.15 
 
 		 756 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.11 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.11 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  30.88 
 
 		 217 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  33.8 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.49 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  35.07 
 
 		 496 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  34.63 
 
 		 743 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 790 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.31 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  35.36 
 
 		 221 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  29.76 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  32.59 
 
 		 721 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  36.49 
 
 		 766 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.65 
 
 		 454 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  33.01 
 
 		 721 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  31.53 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.73 
 
 		 730 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  29.76 
 
 		 233 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  29.27 
 
 		 233 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.96 
 
 		 234 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  34.98 
 
 		 780 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  33.01 
 
 		 786 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  29.76 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  30.39 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  32.51 
 
 		 585 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  36.36 
 
 		 767 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  29.27 
 
 		 233 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  33.7 
 
 		 745 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.13 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.13 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  32.52 
 
 		 730 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  30.9 
 
 		 800 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 730 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  30.54 
 
 		 802 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  32.2 
 
 		 741 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  32.7 
 
 		 779 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  31.88 
 
 		 753 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  35.27 
 
 		 722 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  29.46 
 
 		 755 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  34.02 
 
 		 759 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  32.86 
 
 		 229 aa  106  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  30.96 
 
 		 756 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  30.81 
 
 		 734 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  30.81 
 
 		 750 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  33.01 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  37.43 
 
 		 775 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 		 726 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  31.92 
 
 		 716 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  32.84 
 
 		 211 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  34.62 
 
 		 724 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  33.65 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  33.65 
 
 		 667 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  32 
 
 		 745 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.58 
 
 		 575 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  32 
 
 		 746 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  34.13 
 
 		 723 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  34.13 
 
 		 735 aa  102  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  33.82 
 
 		 723 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  31.22 
 
 		 802 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  31.05 
 
 		 733 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.82 
 
 		 804 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  32.58 
 
 		 509 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  33.71 
 
 		 731 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  32.81 
 
 		 724 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  35.16 
 
 		 803 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  30.1 
 
 		 747 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  31.53 
 
 		 722 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  34.38 
 
 		 774 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  31.5 
 
 		 747 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  31.46 
 
 		 719 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  31.46 
 
 		 719 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  31.46 
 
 		 719 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  31.46 
 
 		 719 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  33.85 
 
 		 505 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  30.87 
 
 		 751 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  31.46 
 
 		 719 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  29.03 
 
 		 257 aa  99.4  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  36.31 
 
 		 795 aa  99  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  32.04 
 
 		 747 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  30.88 
 
 		 453 aa  99.4  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>