More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1793 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1793  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.677381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0150  hypothetical protein  47.64 
 
 		 289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1879  protein-tyrosine kinase  47.65 
 
 		 299 aa  234  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2024  protein-tyrosine kinase  43.14 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.607078  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0244  protein-tyrosine kinase  41.67 
 
 		 309 aa  208  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0736  tyrosine kinase  39.19 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1377  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.45 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2732  tyrosine kinase  37.45 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2365  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.68 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  38.31 
 
 		 246 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35 
 
 		 217 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  30.73 
 
 		 724 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  35 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  33.65 
 
 		 232 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  34.8 
 
 		 734 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.98 
 
 		 575 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  34.41 
 
 		 747 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  32.05 
 
 		 780 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  34.41 
 
 		 747 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  35 
 
 		 753 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  35.5 
 
 		 735 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.47 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.47 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  34.83 
 
 		 759 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.29 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  36.19 
 
 		 754 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  38.55 
 
 		 742 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  32.37 
 
 		 734 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  36.49 
 
 		 736 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  37.44 
 
 		 736 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.56 
 
 		 220 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  37.25 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  35.41 
 
 		 790 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  32.37 
 
 		 734 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  34.31 
 
 		 741 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.5 
 
 		 741 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  33.99 
 
 		 721 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  32.5 
 
 		 741 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  32.5 
 
 		 741 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.17 
 
 		 730 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  31.5 
 
 		 739 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33 
 
 		 780 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.51 
 
 		 225 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  33.5 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  31.37 
 
 		 723 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  34.65 
 
 		 802 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  35.92 
 
 		 736 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  35.29 
 
 		 784 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  32.78 
 
 		 740 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  33.98 
 
 		 719 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  31.61 
 
 		 205 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  35.43 
 
 		 722 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  33.5 
 
 		 730 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  33.98 
 
 		 719 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.8 
 
 		 720 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  37.22 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  32.5 
 
 		 741 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33 
 
 		 736 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  30.88 
 
 		 724 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  34.15 
 
 		 716 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  33.98 
 
 		 719 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  39.43 
 
 		 721 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  33.98 
 
 		 719 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  35.08 
 
 		 750 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.5 
 
 		 741 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  33.5 
 
 		 755 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  31.71 
 
 		 746 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  32.5 
 
 		 741 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  31.58 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  31.68 
 
 		 726 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  33.5 
 
 		 719 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  32.88 
 
 		 784 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  35.96 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  39.88 
 
 		 731 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  33 
 
 		 727 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  35.78 
 
 		 492 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  36.67 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32 
 
 		 741 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  31.71 
 
 		 721 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  34.31 
 
 		 221 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  30.35 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.42 
 
 		 464 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  34.1 
 
 		 723 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  31 
 
 		 739 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  36.67 
 
 		 233 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  31 
 
 		 739 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  35.47 
 
 		 722 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  31 
 
 		 739 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  31.53 
 
 		 225 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  33.48 
 
 		 751 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  36 
 
 		 233 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  30.92 
 
 		 585 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  31.03 
 
 		 225 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 		 235 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  36.78 
 
 		 731 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  31.03 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.43 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  30.54 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  33.33 
 
 		 739 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>