131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3967 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3967  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 852 aa  1572    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1010  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.06 
 
 		 599 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0949  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.24 
 
 		 561 aa  127  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8590  hypothetical protein  37.81 
 
 		 425 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1011  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.96 
 
 		 464 aa  89  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 536 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  27.16 
 
 		 781 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.93 
 
 		 780 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  26.87 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  22.67 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  20.87 
 
 		 806 aa  64.3  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  30.32 
 
 		 794 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  25.14 
 
 		 667 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  37.16 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  25.1 
 
 		 474 aa  60.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  33.55 
 
 		 755 aa  59.7  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.55 
 
 		 800 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  30.72 
 
 		 783 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  32.96 
 
 		 780 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  34.62 
 
 		 472 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  32.2 
 
 		 503 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  30.18 
 
 		 803 aa  56.2  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 738 aa  56.2  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  28 
 
 		 758 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  31.95 
 
 		 789 aa  55.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  30 
 
 		 778 aa  55.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  33.77 
 
 		 211 aa  55.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  32.52 
 
 		 294 aa  54.7  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  22.43 
 
 		 753 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.83 
 
 		 743 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  30.19 
 
 		 776 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  29.05 
 
 		 585 aa  53.5  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  31.11 
 
 		 738 aa  53.5  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  32.52 
 
 		 294 aa  53.5  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  31.1 
 
 		 469 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.58 
 
 		 758 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  29.2 
 
 		 464 aa  52.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  29.22 
 
 		 750 aa  52.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  30.11 
 
 		 790 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  33.56 
 
 		 710 aa  52.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.55 
 
 		 453 aa  52.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 804 aa  52.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  31.69 
 
 		 741 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  31.69 
 
 		 741 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.69 
 
 		 741 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  26.67 
 
 		 484 aa  52  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  32.89 
 
 		 753 aa  52  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.67 
 
 		 711 aa  52  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  26.17 
 
 		 753 aa  52  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  25.14 
 
 		 529 aa  51.6  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  26.83 
 
 		 795 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  32.17 
 
 		 275 aa  51.2  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  27.81 
 
 		 803 aa  51.2  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  26.17 
 
 		 229 aa  51.2  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  25.1 
 
 		 475 aa  51.2  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  26.49 
 
 		 257 aa  50.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  29.24 
 
 		 747 aa  50.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  31.21 
 
 		 797 aa  50.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2447  capsular exopolysaccharide family  28.95 
 
 		 278 aa  50.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  32.64 
 
 		 741 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  30.72 
 
 		 392 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  28.91 
 
 		 746 aa  49.3  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  28.62 
 
 		 788 aa  49.3  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.44 
 
 		 463 aa  49.3  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  29.25 
 
 		 782 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 217 aa  48.9  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  32.39 
 
 		 473 aa  48.9  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  28.98 
 
 		 716 aa  48.9  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.74 
 
 		 575 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.99 
 
 		 741 aa  48.9  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.47 
 
 		 281 aa  48.5  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  32.9 
 
 		 490 aa  48.5  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  33.79 
 
 		 790 aa  48.5  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  28.57 
 
 		 795 aa  48.5  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  28.49 
 
 		 751 aa  48.5  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.34 
 
 		 734 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  31.25 
 
 		 741 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  29.27 
 
 		 509 aa  48.5  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.25 
 
 		 741 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  31.95 
 
 		 771 aa  48.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  27.44 
 
 		 772 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  31.95 
 
 		 789 aa  48.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  30.77 
 
 		 615 aa  48.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  23.65 
 
 		 217 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  26.14 
 
 		 798 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  29.94 
 
 		 750 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  30.34 
 
 		 293 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  32.28 
 
 		 492 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  25.68 
 
 		 246 aa  46.2  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.43 
 
 		 230 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.43 
 
 		 230 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.57 
 
 		 235 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  25.83 
 
 		 225 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.79 
 
 		 284 aa  46.2  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  29.14 
 
 		 443 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 745 aa  46.2  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  30.38 
 
 		 778 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  41.25 
 
 		 764 aa  45.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  30.97 
 
 		 239 aa  45.8  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1834  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 558 aa  45.8  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0495124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>