38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8590 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8590  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  820    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3967  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.02 
 
 		 852 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1010  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.73 
 
 		 599 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0949  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.62 
 
 		 561 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1011  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  54.1 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  29.57 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  27.31 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.23 
 
 		 739 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  34.27 
 
 		 750 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  30.37 
 
 		 473 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  44.64 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 764 aa  49.7  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  31.07 
 
 		 804 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.35 
 
 		 247 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  26.01 
 
 		 529 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 315 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  35.38 
 
 		 778 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  35 
 
 		 496 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.6 
 
 		 772 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  39.68 
 
 		 667 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  36.76 
 
 		 521 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 576 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  31.91 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.88 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  29.53 
 
 		 539 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  29.63 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  30.13 
 
 		 790 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1104  chromosome segregation ATPase-like protein  27.38 
 
 		 1359 aa  44.3  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1180  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 507 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.83 
 
 		 751 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3533  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.08 
 
 		 477 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  26.14 
 
 		 469 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  32.73 
 
 		 247 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2374  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 230 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>