39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3533 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3533  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 320 aa  627  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.82 
 
 		 563 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.274644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4548  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.01 
 
 		 554 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 		 536 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 748 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  27.27 
 
 		 772 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  30.23 
 
 		 790 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 		 745 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 491 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.23 
 
 		 779 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.55 
 
 		 696 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  24.3 
 
 		 753 aa  62.4  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.39 
 
 		 739 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.58 
 
 		 758 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.2 
 
 		 756 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.76 
 
 		 758 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 707 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 707 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 576 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.82 
 
 		 756 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  28.03 
 
 		 750 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  28.57 
 
 		 782 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  26.53 
 
 		 788 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  27.03 
 
 		 771 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 		 751 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  27.03 
 
 		 789 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 		 478 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 701 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  27.98 
 
 		 789 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.75 
 
 		 756 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 509 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 776 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  26.75 
 
 		 764 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 588 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 773 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 		 764 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 		 718 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0359  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  29.37 
 
 		 720 aa  42.7  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.302004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>