28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0785 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0785  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0778  hypothetical protein  99.09 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  69.73 
 
 		 735 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  43.37 
 
 		 720 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  37.93 
 
 		 747 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  34.57 
 
 		 709 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.14 
 
 		 724 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.02 
 
 		 726 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  33.58 
 
 		 713 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  29.5 
 
 		 715 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  27.64 
 
 		 763 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  27.41 
 
 		 742 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  35.38 
 
 		 738 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 784 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  26.47 
 
 		 769 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  26.79 
 
 		 773 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4340  hypothetical protein  30.88 
 
 		 482 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.58 
 
 		 774 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0806  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 507 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  31.2 
 
 		 732 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  30.4 
 
 		 740 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1880  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.68 
 
 		 477 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 804 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  28.46 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  28.47 
 
 		 466 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  25.95 
 
 		 492 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  29.17 
 
 		 525 aa  41.6  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>