24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4340 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4340  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  922    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  34.39 
 
 		 769 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.52 
 
 		 784 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  40.32 
 
 		 773 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  37.31 
 
 		 747 aa  69.3  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  33.55 
 
 		 742 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0806  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.62 
 
 		 507 aa  67  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  36.97 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  33.12 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  37.78 
 
 		 735 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  38.64 
 
 		 715 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.09 
 
 		 759 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1880  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.82 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  32.56 
 
 		 738 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  35.29 
 
 		 713 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 774 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0778  hypothetical protein  30.88 
 
 		 220 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0785  hypothetical protein  30.88 
 
 		 220 aa  47.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.22 
 
 		 724 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.22 
 
 		 726 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  28.7 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.38 
 
 		 790 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.23 
 
 		 804 aa  43.9  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 766 aa  43.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>