More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2813 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 283 aa  564  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  81.18 
 
 		 296 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.11 
 
 		 288 aa  417  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  78.09 
 
 		 291 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  78.85 
 
 		 291 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  78.72 
 
 		 288 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  79.21 
 
 		 291 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  80.74 
 
 		 291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  79.26 
 
 		 291 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.45 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.1 
 
 		 294 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.04 
 
 		 287 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.07 
 
 		 280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.91 
 
 		 292 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.04 
 
 		 296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  51.29 
 
 		 286 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  53.11 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  52.92 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  44.79 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  43.4 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.76 
 
 		 273 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  42.25 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  43.34 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  43.34 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  37.32 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  36.96 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  42.5 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.08 
 
 		 462 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.97 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.93 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  30.92 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.46 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.37 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.38 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.11 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  36.05 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.87 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  27.7 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  33.14 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  30.68 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  30.07 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.01 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.06 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.01 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.54 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  30.51 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  29.34 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.36 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  30.29 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.12 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.14 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  36.36 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  37.01 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  24.91 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.14 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.14 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.04 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.04 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.04 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  30.11 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.14 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.42 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.26 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.06 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  32.14 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.12 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.45 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0396  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.65 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.84 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  30.97 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3388  hypothetical protein  30.52 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853943  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.9 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  34.55 
 
 		 403 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  31.08 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  27.27 
 
 		 406 aa  72.4  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.2 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.13 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.04 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  30.83 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.48 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.12 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  35.06 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  27.8 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.12 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>