More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3388 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3388  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  670    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853943  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.9 
 
 
313 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2477  conjugal plasmid transfer ATPase  42.62 
 
 
256 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826967  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.6 
 
 
258 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.4 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5494  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 
250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188231 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
252 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  37.68 
 
 
263 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.68 
 
 
263 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.68 
 
 
263 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.2 
 
 
263 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  37.56 
 
 
265 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0121  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.92 
 
 
264 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5560  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.8 
 
 
256 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.55 
 
 
263 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2981  PHD family antitoxin/ParA family chromosome partitioning ATPase  34.58 
 
 
341 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.11 
 
 
268 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  36.04 
 
 
263 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  34.29 
 
 
294 aa  102  9e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.4 
 
 
307 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.94 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1833  hypothetical protein  32.23 
 
 
252 aa  99.4  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.214744 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.95 
 
 
294 aa  99  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  34.29 
 
 
262 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.8 
 
 
258 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 
279 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.41 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  34.8 
 
 
253 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 
254 aa  96.3  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.25 
 
 
263 aa  96.3  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
348 aa  95.9  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  33.76 
 
 
266 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  31.75 
 
 
290 aa  95.9  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.43 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.43 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.48 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  32.34 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  33.03 
 
 
263 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.02 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  33.33 
 
 
255 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.27 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.03 
 
 
263 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.03 
 
 
263 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  32.59 
 
 
258 aa  94  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 
298 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.03 
 
 
263 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.45 
 
 
303 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.58 
 
 
267 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  30.66 
 
 
259 aa  93.6  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  30.66 
 
 
259 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.91 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.07 
 
 
270 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.74 
 
 
269 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.85 
 
 
362 aa  92.8  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
256 aa  92.8  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  32.7 
 
 
262 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  32.7 
 
 
262 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  32.1 
 
 
258 aa  92.4  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.97 
 
 
254 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.36 
 
 
309 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.78 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  31.31 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.48 
 
 
317 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  32.86 
 
 
262 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.13 
 
 
312 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.56 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
263 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
263 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.47 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.61 
 
 
254 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.787744  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
263 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
263 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  32.71 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.81 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.02 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.74 
 
 
268 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.95 
 
 
263 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.11 
 
 
263 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  32.41 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.26 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.47 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.7 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.38 
 
 
339 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  33.65 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  32.85 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  33.65 
 
 
335 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  33.65 
 
 
335 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.39 
 
 
256 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
267 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  31.46 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.11 
 
 
337 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>